Protein–RNA interactions for Protein: Q61361

Bcan, Brevican core protein, mousemouse

Predictions only

Length 883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcanQ61361 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BcanQ61361 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BcanQ61361 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BcanQ61361 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BcanQ61361 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BcanQ61361 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BcanQ61361 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
BcanQ61361 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BcanQ61361 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BcanQ61361 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BcanQ61361 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BcanQ61361 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BcanQ61361 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BcanQ61361 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BcanQ61361 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BcanQ61361 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
BcanQ61361 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BcanQ61361 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BcanQ61361 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BcanQ61361 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BcanQ61361 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BcanQ61361 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
BcanQ61361 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
BcanQ61361 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BcanQ61361 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BcanQ61361 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BcanQ61361 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BcanQ61361 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BcanQ61361 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BcanQ61361 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BcanQ61361 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BcanQ61361 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BcanQ61361 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BcanQ61361 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BcanQ61361 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BcanQ61361 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BcanQ61361 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BcanQ61361 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BcanQ61361 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BcanQ61361 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BcanQ61361 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BcanQ61361 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BcanQ61361 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BcanQ61361 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BcanQ61361 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BcanQ61361 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BcanQ61361 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BcanQ61361 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BcanQ61361 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BcanQ61361 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BcanQ61361 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BcanQ61361 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BcanQ61361 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BcanQ61361 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BcanQ61361 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BcanQ61361 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BcanQ61361 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BcanQ61361 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BcanQ61361 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BcanQ61361 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BcanQ61361 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BcanQ61361 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BcanQ61361 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BcanQ61361 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BcanQ61361 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
BcanQ61361 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BcanQ61361 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BcanQ61361 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BcanQ61361 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BcanQ61361 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BcanQ61361 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BcanQ61361 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BcanQ61361 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
BcanQ61361 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BcanQ61361 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
BcanQ61361 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
BcanQ61361 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
BcanQ61361 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BcanQ61361 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BcanQ61361 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BcanQ61361 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BcanQ61361 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BcanQ61361 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BcanQ61361 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BcanQ61361 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
BcanQ61361 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
BcanQ61361 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
BcanQ61361 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
BcanQ61361 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
BcanQ61361 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BcanQ61361 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BcanQ61361 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BcanQ61361 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BcanQ61361 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BcanQ61361 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BcanQ61361 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BcanQ61361 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BcanQ61361 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BcanQ61361 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BcanQ61361 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 120.2 ms