Protein–RNA interactions for Protein: Q61301

Ctnna2, Catenin alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna2Q61301 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ctnna2Q61301 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ctnna2Q61301 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Ctnna2Q61301 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ctnna2Q61301 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ctnna2Q61301 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Ctnna2Q61301 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ctnna2Q61301 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ctnna2Q61301 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ctnna2Q61301 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ctnna2Q61301 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ctnna2Q61301 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ctnna2Q61301 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ctnna2Q61301 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Ctnna2Q61301 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ctnna2Q61301 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ctnna2Q61301 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ctnna2Q61301 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ctnna2Q61301 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ctnna2Q61301 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ctnna2Q61301 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ctnna2Q61301 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ctnna2Q61301 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ctnna2Q61301 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ctnna2Q61301 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ctnna2Q61301 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ctnna2Q61301 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ctnna2Q61301 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ctnna2Q61301 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ctnna2Q61301 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ctnna2Q61301 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ctnna2Q61301 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ctnna2Q61301 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ctnna2Q61301 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ctnna2Q61301 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ctnna2Q61301 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ctnna2Q61301 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ctnna2Q61301 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ctnna2Q61301 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ctnna2Q61301 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ctnna2Q61301 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ctnna2Q61301 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ctnna2Q61301 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ctnna2Q61301 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ctnna2Q61301 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ctnna2Q61301 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ctnna2Q61301 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ctnna2Q61301 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ctnna2Q61301 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Ctnna2Q61301 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ctnna2Q61301 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Ctnna2Q61301 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ctnna2Q61301 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ctnna2Q61301 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ctnna2Q61301 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ctnna2Q61301 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ctnna2Q61301 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ctnna2Q61301 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ctnna2Q61301 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ctnna2Q61301 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ctnna2Q61301 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ctnna2Q61301 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ctnna2Q61301 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ctnna2Q61301 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ctnna2Q61301 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ctnna2Q61301 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ctnna2Q61301 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ctnna2Q61301 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ctnna2Q61301 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ctnna2Q61301 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ctnna2Q61301 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ctnna2Q61301 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ctnna2Q61301 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Ctnna2Q61301 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ctnna2Q61301 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ctnna2Q61301 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ctnna2Q61301 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Ctnna2Q61301 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ctnna2Q61301 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ctnna2Q61301 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ctnna2Q61301 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ctnna2Q61301 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ctnna2Q61301 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ctnna2Q61301 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ctnna2Q61301 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ctnna2Q61301 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ctnna2Q61301 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ctnna2Q61301 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ctnna2Q61301 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ctnna2Q61301 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ctnna2Q61301 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Ctnna2Q61301 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ctnna2Q61301 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ctnna2Q61301 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ctnna2Q61301 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ctnna2Q61301 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ctnna2Q61301 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ctnna2Q61301 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ctnna2Q61301 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ctnna2Q61301 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms