Protein–RNA interactions for Protein: Q61285

Abcd2, ATP-binding cassette sub-family D member 2, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd2Q61285 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Abcd2Q61285 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Abcd2Q61285 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Abcd2Q61285 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Abcd2Q61285 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Abcd2Q61285 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Abcd2Q61285 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Abcd2Q61285 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Abcd2Q61285 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Abcd2Q61285 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Abcd2Q61285 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Abcd2Q61285 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Abcd2Q61285 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Abcd2Q61285 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Abcd2Q61285 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Abcd2Q61285 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Abcd2Q61285 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Abcd2Q61285 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Abcd2Q61285 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Abcd2Q61285 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Abcd2Q61285 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Abcd2Q61285 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Abcd2Q61285 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Abcd2Q61285 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Abcd2Q61285 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Abcd2Q61285 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Abcd2Q61285 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Abcd2Q61285 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Abcd2Q61285 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Abcd2Q61285 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Abcd2Q61285 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Abcd2Q61285 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Abcd2Q61285 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Abcd2Q61285 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Abcd2Q61285 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Abcd2Q61285 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Abcd2Q61285 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Abcd2Q61285 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Abcd2Q61285 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Abcd2Q61285 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Abcd2Q61285 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Abcd2Q61285 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Abcd2Q61285 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Abcd2Q61285 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Abcd2Q61285 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Abcd2Q61285 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Abcd2Q61285 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Abcd2Q61285 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Abcd2Q61285 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Abcd2Q61285 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Abcd2Q61285 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Abcd2Q61285 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Abcd2Q61285 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Abcd2Q61285 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Abcd2Q61285 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Abcd2Q61285 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Abcd2Q61285 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Abcd2Q61285 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Abcd2Q61285 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Abcd2Q61285 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Abcd2Q61285 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Abcd2Q61285 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Abcd2Q61285 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Abcd2Q61285 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Abcd2Q61285 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Abcd2Q61285 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Abcd2Q61285 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Abcd2Q61285 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Abcd2Q61285 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Abcd2Q61285 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Abcd2Q61285 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Abcd2Q61285 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Abcd2Q61285 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Abcd2Q61285 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Abcd2Q61285 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Abcd2Q61285 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Abcd2Q61285 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Abcd2Q61285 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Abcd2Q61285 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Abcd2Q61285 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Abcd2Q61285 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Abcd2Q61285 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Abcd2Q61285 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Abcd2Q61285 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Abcd2Q61285 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Abcd2Q61285 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Abcd2Q61285 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Abcd2Q61285 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Abcd2Q61285 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Abcd2Q61285 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Abcd2Q61285 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Abcd2Q61285 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Abcd2Q61285 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Abcd2Q61285 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Abcd2Q61285 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Abcd2Q61285 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Abcd2Q61285 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Abcd2Q61285 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Abcd2Q61285 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Abcd2Q61285 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms