Protein–RNA interactions for Protein: Q61144

Psen2, Presenilin-2, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psen2Q61144 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Psen2Q61144 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Psen2Q61144 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Psen2Q61144 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Psen2Q61144 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Psen2Q61144 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Psen2Q61144 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Psen2Q61144 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Psen2Q61144 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Psen2Q61144 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Psen2Q61144 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Psen2Q61144 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Psen2Q61144 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Psen2Q61144 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Psen2Q61144 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Psen2Q61144 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Psen2Q61144 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Psen2Q61144 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Psen2Q61144 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Psen2Q61144 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Psen2Q61144 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Psen2Q61144 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Psen2Q61144 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Psen2Q61144 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Psen2Q61144 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Psen2Q61144 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Psen2Q61144 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Psen2Q61144 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Psen2Q61144 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Psen2Q61144 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Psen2Q61144 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Psen2Q61144 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Psen2Q61144 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Psen2Q61144 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Psen2Q61144 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Psen2Q61144 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Psen2Q61144 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Psen2Q61144 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Psen2Q61144 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Psen2Q61144 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Psen2Q61144 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Psen2Q61144 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Psen2Q61144 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Psen2Q61144 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Psen2Q61144 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Psen2Q61144 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Psen2Q61144 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Psen2Q61144 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Psen2Q61144 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Psen2Q61144 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Psen2Q61144 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Psen2Q61144 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Psen2Q61144 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Psen2Q61144 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Psen2Q61144 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Psen2Q61144 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Psen2Q61144 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Psen2Q61144 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Psen2Q61144 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Psen2Q61144 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Psen2Q61144 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Psen2Q61144 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Psen2Q61144 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Psen2Q61144 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Psen2Q61144 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Psen2Q61144 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Psen2Q61144 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Psen2Q61144 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Psen2Q61144 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Psen2Q61144 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Psen2Q61144 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Psen2Q61144 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Psen2Q61144 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Psen2Q61144 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Psen2Q61144 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Psen2Q61144 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Psen2Q61144 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Psen2Q61144 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Psen2Q61144 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Psen2Q61144 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Psen2Q61144 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Psen2Q61144 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Psen2Q61144 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Psen2Q61144 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Psen2Q61144 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Psen2Q61144 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Psen2Q61144 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Psen2Q61144 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Psen2Q61144 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Psen2Q61144 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Psen2Q61144 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Psen2Q61144 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Psen2Q61144 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Psen2Q61144 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Psen2Q61144 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Psen2Q61144 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Psen2Q61144 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Psen2Q61144 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Psen2Q61144 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Psen2Q61144 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms