Protein–RNA interactions for Protein: Q61087

Lamb3, Laminin subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamb3Q61087 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lamb3Q61087 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lamb3Q61087 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lamb3Q61087 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lamb3Q61087 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lamb3Q61087 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lamb3Q61087 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lamb3Q61087 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lamb3Q61087 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Lamb3Q61087 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Lamb3Q61087 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lamb3Q61087 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lamb3Q61087 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lamb3Q61087 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lamb3Q61087 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lamb3Q61087 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lamb3Q61087 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lamb3Q61087 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lamb3Q61087 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lamb3Q61087 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lamb3Q61087 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lamb3Q61087 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lamb3Q61087 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lamb3Q61087 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lamb3Q61087 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lamb3Q61087 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lamb3Q61087 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lamb3Q61087 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lamb3Q61087 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lamb3Q61087 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lamb3Q61087 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lamb3Q61087 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lamb3Q61087 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lamb3Q61087 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Lamb3Q61087 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lamb3Q61087 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lamb3Q61087 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lamb3Q61087 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lamb3Q61087 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lamb3Q61087 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lamb3Q61087 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lamb3Q61087 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Lamb3Q61087 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lamb3Q61087 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lamb3Q61087 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lamb3Q61087 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lamb3Q61087 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lamb3Q61087 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lamb3Q61087 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lamb3Q61087 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lamb3Q61087 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lamb3Q61087 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lamb3Q61087 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lamb3Q61087 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lamb3Q61087 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lamb3Q61087 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lamb3Q61087 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lamb3Q61087 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lamb3Q61087 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lamb3Q61087 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lamb3Q61087 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lamb3Q61087 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lamb3Q61087 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lamb3Q61087 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lamb3Q61087 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lamb3Q61087 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lamb3Q61087 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lamb3Q61087 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lamb3Q61087 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lamb3Q61087 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lamb3Q61087 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lamb3Q61087 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lamb3Q61087 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lamb3Q61087 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lamb3Q61087 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lamb3Q61087 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Lamb3Q61087 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lamb3Q61087 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lamb3Q61087 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lamb3Q61087 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lamb3Q61087 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lamb3Q61087 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lamb3Q61087 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Lamb3Q61087 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lamb3Q61087 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lamb3Q61087 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lamb3Q61087 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lamb3Q61087 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lamb3Q61087 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lamb3Q61087 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lamb3Q61087 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lamb3Q61087 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lamb3Q61087 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lamb3Q61087 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lamb3Q61087 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lamb3Q61087 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lamb3Q61087 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lamb3Q61087 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lamb3Q61087 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Lamb3Q61087 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms