Protein–RNA interactions for Protein: Q60960

Kpna1, Importin subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna1Q60960 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Kpna1Q60960 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Kpna1Q60960 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Kpna1Q60960 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Kpna1Q60960 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Kpna1Q60960 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Kpna1Q60960 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Kpna1Q60960 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Kpna1Q60960 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Kpna1Q60960 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Kpna1Q60960 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Kpna1Q60960 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Kpna1Q60960 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Kpna1Q60960 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Kpna1Q60960 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Kpna1Q60960 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Kpna1Q60960 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Kpna1Q60960 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Kpna1Q60960 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Kpna1Q60960 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Kpna1Q60960 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Kpna1Q60960 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Kpna1Q60960 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Kpna1Q60960 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Kpna1Q60960 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Kpna1Q60960 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Kpna1Q60960 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Kpna1Q60960 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Kpna1Q60960 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Kpna1Q60960 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Kpna1Q60960 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Kpna1Q60960 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Kpna1Q60960 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Kpna1Q60960 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Kpna1Q60960 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Kpna1Q60960 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Kpna1Q60960 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Kpna1Q60960 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Kpna1Q60960 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Kpna1Q60960 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Kpna1Q60960 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Kpna1Q60960 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Kpna1Q60960 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Kpna1Q60960 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Kpna1Q60960 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Kpna1Q60960 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Kpna1Q60960 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Kpna1Q60960 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Kpna1Q60960 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Kpna1Q60960 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Kpna1Q60960 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Kpna1Q60960 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Kpna1Q60960 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Kpna1Q60960 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Kpna1Q60960 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Kpna1Q60960 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Kpna1Q60960 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Kpna1Q60960 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Kpna1Q60960 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Kpna1Q60960 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Kpna1Q60960 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Kpna1Q60960 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Kpna1Q60960 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Kpna1Q60960 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Kpna1Q60960 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Kpna1Q60960 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Kpna1Q60960 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Kpna1Q60960 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Kpna1Q60960 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Kpna1Q60960 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Kpna1Q60960 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Kpna1Q60960 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Kpna1Q60960 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Kpna1Q60960 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Kpna1Q60960 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Kpna1Q60960 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Kpna1Q60960 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Kpna1Q60960 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Kpna1Q60960 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Kpna1Q60960 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Kpna1Q60960 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Kpna1Q60960 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Kpna1Q60960 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Kpna1Q60960 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Kpna1Q60960 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Kpna1Q60960 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Kpna1Q60960 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Kpna1Q60960 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Kpna1Q60960 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Kpna1Q60960 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Kpna1Q60960 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Kpna1Q60960 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Kpna1Q60960 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Kpna1Q60960 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Kpna1Q60960 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Kpna1Q60960 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Kpna1Q60960 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Kpna1Q60960 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Kpna1Q60960 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Kpna1Q60960 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms