Protein–RNA interactions for Protein: Q60954

Meis1, Homeobox protein Meis1, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Meis1Q60954 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Meis1Q60954 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Meis1Q60954 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Meis1Q60954 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Meis1Q60954 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Meis1Q60954 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Meis1Q60954 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Meis1Q60954 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Meis1Q60954 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Meis1Q60954 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Meis1Q60954 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Meis1Q60954 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Meis1Q60954 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Meis1Q60954 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Meis1Q60954 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Meis1Q60954 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Meis1Q60954 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Meis1Q60954 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Meis1Q60954 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Meis1Q60954 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Meis1Q60954 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Meis1Q60954 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Meis1Q60954 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Meis1Q60954 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Meis1Q60954 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Meis1Q60954 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Meis1Q60954 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Meis1Q60954 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Meis1Q60954 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Meis1Q60954 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Meis1Q60954 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Meis1Q60954 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Meis1Q60954 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Meis1Q60954 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Meis1Q60954 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Meis1Q60954 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Meis1Q60954 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Meis1Q60954 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Meis1Q60954 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Meis1Q60954 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Meis1Q60954 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Meis1Q60954 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Meis1Q60954 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Meis1Q60954 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Meis1Q60954 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Meis1Q60954 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Meis1Q60954 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Meis1Q60954 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Meis1Q60954 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Meis1Q60954 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Meis1Q60954 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Meis1Q60954 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Meis1Q60954 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Meis1Q60954 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Meis1Q60954 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Meis1Q60954 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Meis1Q60954 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Meis1Q60954 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Meis1Q60954 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Meis1Q60954 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Meis1Q60954 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Meis1Q60954 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Meis1Q60954 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Meis1Q60954 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Meis1Q60954 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Meis1Q60954 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Meis1Q60954 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Meis1Q60954 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Meis1Q60954 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Meis1Q60954 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Meis1Q60954 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Meis1Q60954 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Meis1Q60954 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Meis1Q60954 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Meis1Q60954 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Meis1Q60954 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Meis1Q60954 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Meis1Q60954 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Meis1Q60954 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Meis1Q60954 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Meis1Q60954 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Meis1Q60954 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Meis1Q60954 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Meis1Q60954 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Meis1Q60954 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Meis1Q60954 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Meis1Q60954 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Meis1Q60954 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Meis1Q60954 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Meis1Q60954 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Meis1Q60954 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Meis1Q60954 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Meis1Q60954 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Meis1Q60954 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Meis1Q60954 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Meis1Q60954 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Meis1Q60954 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Meis1Q60954 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Meis1Q60954 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Meis1Q60954 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms