Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Traf3Q60803 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Traf3Q60803 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Traf3Q60803 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Traf3Q60803 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Traf3Q60803 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Traf3Q60803 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Traf3Q60803 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Traf3Q60803 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Traf3Q60803 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Traf3Q60803 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Traf3Q60803 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Traf3Q60803 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Traf3Q60803 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Traf3Q60803 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Traf3Q60803 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Traf3Q60803 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Traf3Q60803 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Traf3Q60803 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Traf3Q60803 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Traf3Q60803 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Traf3Q60803 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Traf3Q60803 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Traf3Q60803 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Traf3Q60803 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Traf3Q60803 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Traf3Q60803 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Traf3Q60803 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Traf3Q60803 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Traf3Q60803 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Traf3Q60803 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Traf3Q60803 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Traf3Q60803 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Traf3Q60803 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Traf3Q60803 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Traf3Q60803 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Traf3Q60803 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Traf3Q60803 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Traf3Q60803 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Traf3Q60803 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Traf3Q60803 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Traf3Q60803 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Traf3Q60803 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Traf3Q60803 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Traf3Q60803 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Traf3Q60803 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Traf3Q60803 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Traf3Q60803 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Traf3Q60803 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Traf3Q60803 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Traf3Q60803 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Traf3Q60803 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Traf3Q60803 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Traf3Q60803 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Traf3Q60803 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Traf3Q60803 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Traf3Q60803 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Traf3Q60803 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Traf3Q60803 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Traf3Q60803 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Traf3Q60803 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Traf3Q60803 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Traf3Q60803 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Traf3Q60803 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Traf3Q60803 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Traf3Q60803 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Traf3Q60803 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Traf3Q60803 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Traf3Q60803 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Traf3Q60803 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Traf3Q60803 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Traf3Q60803 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Traf3Q60803 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Traf3Q60803 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Traf3Q60803 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Traf3Q60803 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Traf3Q60803 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Traf3Q60803 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Traf3Q60803 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Traf3Q60803 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Traf3Q60803 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Traf3Q60803 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Traf3Q60803 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Traf3Q60803 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Traf3Q60803 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Traf3Q60803 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Traf3Q60803 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Traf3Q60803 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Traf3Q60803 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Traf3Q60803 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Traf3Q60803 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Traf3Q60803 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Traf3Q60803 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Traf3Q60803 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Traf3Q60803 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Traf3Q60803 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Traf3Q60803 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Traf3Q60803 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Traf3Q60803 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Traf3Q60803 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms