Protein–RNA interactions for Protein: Q60772

Cdkn2c, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor C, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2cQ60772 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdkn2cQ60772 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdkn2cQ60772 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdkn2cQ60772 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdkn2cQ60772 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdkn2cQ60772 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdkn2cQ60772 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdkn2cQ60772 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdkn2cQ60772 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdkn2cQ60772 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdkn2cQ60772 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdkn2cQ60772 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdkn2cQ60772 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdkn2cQ60772 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdkn2cQ60772 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdkn2cQ60772 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdkn2cQ60772 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdkn2cQ60772 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdkn2cQ60772 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdkn2cQ60772 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdkn2cQ60772 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdkn2cQ60772 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdkn2cQ60772 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdkn2cQ60772 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdkn2cQ60772 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdkn2cQ60772 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdkn2cQ60772 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdkn2cQ60772 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdkn2cQ60772 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdkn2cQ60772 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdkn2cQ60772 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdkn2cQ60772 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdkn2cQ60772 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdkn2cQ60772 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdkn2cQ60772 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdkn2cQ60772 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdkn2cQ60772 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdkn2cQ60772 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdkn2cQ60772 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdkn2cQ60772 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdkn2cQ60772 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cdkn2cQ60772 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cdkn2cQ60772 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cdkn2cQ60772 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cdkn2cQ60772 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cdkn2cQ60772 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cdkn2cQ60772 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cdkn2cQ60772 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cdkn2cQ60772 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cdkn2cQ60772 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cdkn2cQ60772 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cdkn2cQ60772 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cdkn2cQ60772 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cdkn2cQ60772 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdkn2cQ60772 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdkn2cQ60772 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdkn2cQ60772 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdkn2cQ60772 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdkn2cQ60772 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdkn2cQ60772 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdkn2cQ60772 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdkn2cQ60772 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdkn2cQ60772 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdkn2cQ60772 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdkn2cQ60772 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdkn2cQ60772 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdkn2cQ60772 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdkn2cQ60772 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdkn2cQ60772 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdkn2cQ60772 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdkn2cQ60772 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdkn2cQ60772 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdkn2cQ60772 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdkn2cQ60772 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdkn2cQ60772 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdkn2cQ60772 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdkn2cQ60772 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdkn2cQ60772 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdkn2cQ60772 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdkn2cQ60772 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdkn2cQ60772 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdkn2cQ60772 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdkn2cQ60772 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdkn2cQ60772 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdkn2cQ60772 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdkn2cQ60772 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdkn2cQ60772 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdkn2cQ60772 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdkn2cQ60772 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdkn2cQ60772 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdkn2cQ60772 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdkn2cQ60772 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdkn2cQ60772 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdkn2cQ60772 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdkn2cQ60772 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdkn2cQ60772 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdkn2cQ60772 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdkn2cQ60772 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdkn2cQ60772 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdkn2cQ60772 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms