Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prdm1Q60636 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prdm1Q60636 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prdm1Q60636 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prdm1Q60636 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prdm1Q60636 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prdm1Q60636 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prdm1Q60636 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prdm1Q60636 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prdm1Q60636 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prdm1Q60636 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prdm1Q60636 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prdm1Q60636 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prdm1Q60636 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prdm1Q60636 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prdm1Q60636 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prdm1Q60636 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prdm1Q60636 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prdm1Q60636 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prdm1Q60636 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prdm1Q60636 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prdm1Q60636 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prdm1Q60636 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prdm1Q60636 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prdm1Q60636 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prdm1Q60636 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Prdm1Q60636 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prdm1Q60636 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prdm1Q60636 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Prdm1Q60636 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prdm1Q60636 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Prdm1Q60636 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prdm1Q60636 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prdm1Q60636 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prdm1Q60636 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prdm1Q60636 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Prdm1Q60636 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prdm1Q60636 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prdm1Q60636 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prdm1Q60636 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prdm1Q60636 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prdm1Q60636 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prdm1Q60636 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prdm1Q60636 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Prdm1Q60636 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Prdm1Q60636 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prdm1Q60636 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prdm1Q60636 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prdm1Q60636 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prdm1Q60636 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prdm1Q60636 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Prdm1Q60636 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prdm1Q60636 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Prdm1Q60636 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prdm1Q60636 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prdm1Q60636 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prdm1Q60636 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Prdm1Q60636 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prdm1Q60636 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prdm1Q60636 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prdm1Q60636 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prdm1Q60636 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prdm1Q60636 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prdm1Q60636 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prdm1Q60636 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prdm1Q60636 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prdm1Q60636 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prdm1Q60636 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prdm1Q60636 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prdm1Q60636 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prdm1Q60636 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prdm1Q60636 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prdm1Q60636 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prdm1Q60636 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prdm1Q60636 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Prdm1Q60636 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prdm1Q60636 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prdm1Q60636 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Prdm1Q60636 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prdm1Q60636 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prdm1Q60636 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prdm1Q60636 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prdm1Q60636 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prdm1Q60636 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Prdm1Q60636 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prdm1Q60636 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prdm1Q60636 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prdm1Q60636 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prdm1Q60636 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prdm1Q60636 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prdm1Q60636 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prdm1Q60636 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prdm1Q60636 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prdm1Q60636 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prdm1Q60636 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prdm1Q60636 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prdm1Q60636 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prdm1Q60636 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prdm1Q60636 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prdm1Q60636 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.1 ms