Protein–RNA interactions for Protein: Q60519

Sema5b, Semaphorin-5B, mousemouse

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema5bQ60519 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sema5bQ60519 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sema5bQ60519 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sema5bQ60519 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sema5bQ60519 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sema5bQ60519 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Sema5bQ60519 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sema5bQ60519 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sema5bQ60519 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sema5bQ60519 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sema5bQ60519 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sema5bQ60519 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sema5bQ60519 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sema5bQ60519 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sema5bQ60519 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Sema5bQ60519 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sema5bQ60519 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sema5bQ60519 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sema5bQ60519 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sema5bQ60519 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sema5bQ60519 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sema5bQ60519 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sema5bQ60519 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sema5bQ60519 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sema5bQ60519 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sema5bQ60519 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sema5bQ60519 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sema5bQ60519 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sema5bQ60519 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sema5bQ60519 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Sema5bQ60519 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sema5bQ60519 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sema5bQ60519 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sema5bQ60519 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sema5bQ60519 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sema5bQ60519 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sema5bQ60519 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sema5bQ60519 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sema5bQ60519 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sema5bQ60519 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sema5bQ60519 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sema5bQ60519 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Sema5bQ60519 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sema5bQ60519 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sema5bQ60519 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sema5bQ60519 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sema5bQ60519 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sema5bQ60519 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sema5bQ60519 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sema5bQ60519 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sema5bQ60519 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sema5bQ60519 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sema5bQ60519 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sema5bQ60519 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sema5bQ60519 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sema5bQ60519 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sema5bQ60519 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Sema5bQ60519 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sema5bQ60519 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sema5bQ60519 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sema5bQ60519 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sema5bQ60519 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sema5bQ60519 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sema5bQ60519 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sema5bQ60519 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sema5bQ60519 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sema5bQ60519 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sema5bQ60519 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sema5bQ60519 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sema5bQ60519 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sema5bQ60519 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sema5bQ60519 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Sema5bQ60519 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sema5bQ60519 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sema5bQ60519 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Sema5bQ60519 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sema5bQ60519 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sema5bQ60519 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sema5bQ60519 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sema5bQ60519 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sema5bQ60519 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sema5bQ60519 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sema5bQ60519 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sema5bQ60519 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sema5bQ60519 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sema5bQ60519 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sema5bQ60519 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sema5bQ60519 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sema5bQ60519 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sema5bQ60519 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Sema5bQ60519 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Sema5bQ60519 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sema5bQ60519 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sema5bQ60519 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sema5bQ60519 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sema5bQ60519 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sema5bQ60519 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Sema5bQ60519 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Sema5bQ60519 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sema5bQ60519 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms