Protein–RNA interactions for Protein: Q5XG71

Utp20, Small subunit processome component 20 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp20Q5XG71 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Utp20Q5XG71 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Utp20Q5XG71 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Utp20Q5XG71 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Utp20Q5XG71 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Utp20Q5XG71 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Utp20Q5XG71 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Utp20Q5XG71 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Utp20Q5XG71 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Utp20Q5XG71 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Utp20Q5XG71 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Utp20Q5XG71 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Utp20Q5XG71 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Utp20Q5XG71 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Utp20Q5XG71 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Utp20Q5XG71 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Utp20Q5XG71 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Utp20Q5XG71 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Utp20Q5XG71 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Utp20Q5XG71 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Utp20Q5XG71 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Utp20Q5XG71 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Utp20Q5XG71 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Utp20Q5XG71 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Utp20Q5XG71 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Utp20Q5XG71 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Utp20Q5XG71 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Utp20Q5XG71 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Utp20Q5XG71 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Utp20Q5XG71 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Utp20Q5XG71 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Utp20Q5XG71 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Utp20Q5XG71 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Utp20Q5XG71 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Utp20Q5XG71 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Utp20Q5XG71 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Utp20Q5XG71 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Utp20Q5XG71 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Utp20Q5XG71 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Utp20Q5XG71 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Utp20Q5XG71 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Utp20Q5XG71 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Utp20Q5XG71 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Utp20Q5XG71 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Utp20Q5XG71 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Utp20Q5XG71 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Utp20Q5XG71 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Utp20Q5XG71 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Utp20Q5XG71 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Utp20Q5XG71 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Utp20Q5XG71 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Utp20Q5XG71 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Utp20Q5XG71 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Utp20Q5XG71 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Utp20Q5XG71 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Utp20Q5XG71 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Utp20Q5XG71 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Utp20Q5XG71 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Utp20Q5XG71 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Utp20Q5XG71 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Utp20Q5XG71 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Utp20Q5XG71 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Utp20Q5XG71 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Utp20Q5XG71 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Utp20Q5XG71 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Utp20Q5XG71 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Utp20Q5XG71 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Utp20Q5XG71 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Utp20Q5XG71 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Utp20Q5XG71 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Utp20Q5XG71 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Utp20Q5XG71 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Utp20Q5XG71 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Utp20Q5XG71 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Utp20Q5XG71 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Utp20Q5XG71 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Utp20Q5XG71 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Utp20Q5XG71 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Utp20Q5XG71 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Utp20Q5XG71 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Utp20Q5XG71 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Utp20Q5XG71 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Utp20Q5XG71 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Utp20Q5XG71 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Utp20Q5XG71 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Utp20Q5XG71 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Utp20Q5XG71 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Utp20Q5XG71 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Utp20Q5XG71 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Utp20Q5XG71 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Utp20Q5XG71 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Utp20Q5XG71 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Utp20Q5XG71 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Utp20Q5XG71 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Utp20Q5XG71 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Utp20Q5XG71 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Utp20Q5XG71 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Utp20Q5XG71 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Utp20Q5XG71 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Utp20Q5XG71 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms