Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4C3

Scaf1, Splicing factor, arginine/serine-rich 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf1Q5U4C3 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Scaf1Q5U4C3 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Scaf1Q5U4C3 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Scaf1Q5U4C3 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Scaf1Q5U4C3 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Scaf1Q5U4C3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Scaf1Q5U4C3 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Scaf1Q5U4C3 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Scaf1Q5U4C3 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Scaf1Q5U4C3 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Scaf1Q5U4C3 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Scaf1Q5U4C3 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Scaf1Q5U4C3 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Scaf1Q5U4C3 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Scaf1Q5U4C3 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Scaf1Q5U4C3 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Scaf1Q5U4C3 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Scaf1Q5U4C3 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Scaf1Q5U4C3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Scaf1Q5U4C3 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Scaf1Q5U4C3 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Scaf1Q5U4C3 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Scaf1Q5U4C3 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Scaf1Q5U4C3 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Scaf1Q5U4C3 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Scaf1Q5U4C3 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Scaf1Q5U4C3 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Scaf1Q5U4C3 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Scaf1Q5U4C3 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Scaf1Q5U4C3 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Scaf1Q5U4C3 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Scaf1Q5U4C3 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Scaf1Q5U4C3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Scaf1Q5U4C3 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Scaf1Q5U4C3 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Scaf1Q5U4C3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Scaf1Q5U4C3 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Scaf1Q5U4C3 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Scaf1Q5U4C3 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Scaf1Q5U4C3 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Scaf1Q5U4C3 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Scaf1Q5U4C3 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Scaf1Q5U4C3 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Scaf1Q5U4C3 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Scaf1Q5U4C3 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Scaf1Q5U4C3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Scaf1Q5U4C3 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Scaf1Q5U4C3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Scaf1Q5U4C3 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Scaf1Q5U4C3 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Scaf1Q5U4C3 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Scaf1Q5U4C3 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Scaf1Q5U4C3 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Scaf1Q5U4C3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Scaf1Q5U4C3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Scaf1Q5U4C3 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Scaf1Q5U4C3 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Scaf1Q5U4C3 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Scaf1Q5U4C3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Scaf1Q5U4C3 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Scaf1Q5U4C3 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Scaf1Q5U4C3 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Scaf1Q5U4C3 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Scaf1Q5U4C3 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Scaf1Q5U4C3 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Scaf1Q5U4C3 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Scaf1Q5U4C3 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Scaf1Q5U4C3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Scaf1Q5U4C3 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Scaf1Q5U4C3 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Scaf1Q5U4C3 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Scaf1Q5U4C3 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Scaf1Q5U4C3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Scaf1Q5U4C3 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Scaf1Q5U4C3 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Scaf1Q5U4C3 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Scaf1Q5U4C3 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Scaf1Q5U4C3 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Scaf1Q5U4C3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Scaf1Q5U4C3 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Scaf1Q5U4C3 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Scaf1Q5U4C3 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Scaf1Q5U4C3 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Scaf1Q5U4C3 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Scaf1Q5U4C3 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Scaf1Q5U4C3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Scaf1Q5U4C3 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Scaf1Q5U4C3 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Scaf1Q5U4C3 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Scaf1Q5U4C3 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Scaf1Q5U4C3 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Scaf1Q5U4C3 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Scaf1Q5U4C3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Scaf1Q5U4C3 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Scaf1Q5U4C3 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Scaf1Q5U4C3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Scaf1Q5U4C3 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Scaf1Q5U4C3 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Scaf1Q5U4C3 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Scaf1Q5U4C3 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms