Protein–RNA interactions for Protein: Q5U458

Dnajc11, DnaJ homolog subfamily C member 11, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc11Q5U458 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Dnajc11Q5U458 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dnajc11Q5U458 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dnajc11Q5U458 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dnajc11Q5U458 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dnajc11Q5U458 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dnajc11Q5U458 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dnajc11Q5U458 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dnajc11Q5U458 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dnajc11Q5U458 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dnajc11Q5U458 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dnajc11Q5U458 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dnajc11Q5U458 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dnajc11Q5U458 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dnajc11Q5U458 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dnajc11Q5U458 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dnajc11Q5U458 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dnajc11Q5U458 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dnajc11Q5U458 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dnajc11Q5U458 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dnajc11Q5U458 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dnajc11Q5U458 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dnajc11Q5U458 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dnajc11Q5U458 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Dnajc11Q5U458 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dnajc11Q5U458 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dnajc11Q5U458 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dnajc11Q5U458 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dnajc11Q5U458 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dnajc11Q5U458 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dnajc11Q5U458 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dnajc11Q5U458 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dnajc11Q5U458 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dnajc11Q5U458 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dnajc11Q5U458 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dnajc11Q5U458 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dnajc11Q5U458 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dnajc11Q5U458 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dnajc11Q5U458 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dnajc11Q5U458 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dnajc11Q5U458 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dnajc11Q5U458 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dnajc11Q5U458 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dnajc11Q5U458 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dnajc11Q5U458 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dnajc11Q5U458 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dnajc11Q5U458 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dnajc11Q5U458 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dnajc11Q5U458 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dnajc11Q5U458 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dnajc11Q5U458 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Dnajc11Q5U458 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Dnajc11Q5U458 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dnajc11Q5U458 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dnajc11Q5U458 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dnajc11Q5U458 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dnajc11Q5U458 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Dnajc11Q5U458 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dnajc11Q5U458 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dnajc11Q5U458 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dnajc11Q5U458 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dnajc11Q5U458 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dnajc11Q5U458 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Dnajc11Q5U458 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Dnajc11Q5U458 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dnajc11Q5U458 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dnajc11Q5U458 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dnajc11Q5U458 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dnajc11Q5U458 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dnajc11Q5U458 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dnajc11Q5U458 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dnajc11Q5U458 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dnajc11Q5U458 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dnajc11Q5U458 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dnajc11Q5U458 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Dnajc11Q5U458 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dnajc11Q5U458 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dnajc11Q5U458 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dnajc11Q5U458 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dnajc11Q5U458 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dnajc11Q5U458 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dnajc11Q5U458 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dnajc11Q5U458 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dnajc11Q5U458 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dnajc11Q5U458 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dnajc11Q5U458 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dnajc11Q5U458 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dnajc11Q5U458 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dnajc11Q5U458 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dnajc11Q5U458 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dnajc11Q5U458 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dnajc11Q5U458 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dnajc11Q5U458 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dnajc11Q5U458 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dnajc11Q5U458 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Dnajc11Q5U458 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dnajc11Q5U458 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dnajc11Q5U458 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dnajc11Q5U458 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dnajc11Q5U458 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms