Protein–RNA interactions for Protein: Q5U3K5

Rabl6, Rab-like protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabl6Q5U3K5 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Rabl6Q5U3K5 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rabl6Q5U3K5 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rabl6Q5U3K5 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rabl6Q5U3K5 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rabl6Q5U3K5 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rabl6Q5U3K5 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rabl6Q5U3K5 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Rabl6Q5U3K5 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rabl6Q5U3K5 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rabl6Q5U3K5 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rabl6Q5U3K5 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rabl6Q5U3K5 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rabl6Q5U3K5 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rabl6Q5U3K5 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Rabl6Q5U3K5 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rabl6Q5U3K5 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rabl6Q5U3K5 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rabl6Q5U3K5 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rabl6Q5U3K5 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rabl6Q5U3K5 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rabl6Q5U3K5 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rabl6Q5U3K5 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rabl6Q5U3K5 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rabl6Q5U3K5 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rabl6Q5U3K5 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rabl6Q5U3K5 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rabl6Q5U3K5 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rabl6Q5U3K5 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rabl6Q5U3K5 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rabl6Q5U3K5 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rabl6Q5U3K5 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rabl6Q5U3K5 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rabl6Q5U3K5 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rabl6Q5U3K5 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rabl6Q5U3K5 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rabl6Q5U3K5 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rabl6Q5U3K5 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rabl6Q5U3K5 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rabl6Q5U3K5 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rabl6Q5U3K5 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rabl6Q5U3K5 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rabl6Q5U3K5 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rabl6Q5U3K5 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rabl6Q5U3K5 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rabl6Q5U3K5 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rabl6Q5U3K5 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rabl6Q5U3K5 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rabl6Q5U3K5 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rabl6Q5U3K5 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rabl6Q5U3K5 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rabl6Q5U3K5 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rabl6Q5U3K5 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rabl6Q5U3K5 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rabl6Q5U3K5 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rabl6Q5U3K5 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rabl6Q5U3K5 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rabl6Q5U3K5 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rabl6Q5U3K5 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rabl6Q5U3K5 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Rabl6Q5U3K5 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rabl6Q5U3K5 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Rabl6Q5U3K5 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rabl6Q5U3K5 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rabl6Q5U3K5 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Rabl6Q5U3K5 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rabl6Q5U3K5 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rabl6Q5U3K5 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rabl6Q5U3K5 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rabl6Q5U3K5 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rabl6Q5U3K5 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rabl6Q5U3K5 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rabl6Q5U3K5 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rabl6Q5U3K5 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rabl6Q5U3K5 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rabl6Q5U3K5 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rabl6Q5U3K5 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rabl6Q5U3K5 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rabl6Q5U3K5 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rabl6Q5U3K5 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rabl6Q5U3K5 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rabl6Q5U3K5 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rabl6Q5U3K5 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Rabl6Q5U3K5 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rabl6Q5U3K5 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rabl6Q5U3K5 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Rabl6Q5U3K5 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rabl6Q5U3K5 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rabl6Q5U3K5 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rabl6Q5U3K5 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rabl6Q5U3K5 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Rabl6Q5U3K5 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rabl6Q5U3K5 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Rabl6Q5U3K5 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rabl6Q5U3K5 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rabl6Q5U3K5 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rabl6Q5U3K5 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rabl6Q5U3K5 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rabl6Q5U3K5 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rabl6Q5U3K5 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms