Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV66

Ccdc42, Coiled-coil domain-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc42Q5SV66 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc42Q5SV66 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc42Q5SV66 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc42Q5SV66 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc42Q5SV66 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc42Q5SV66 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc42Q5SV66 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc42Q5SV66 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc42Q5SV66 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc42Q5SV66 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc42Q5SV66 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc42Q5SV66 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc42Q5SV66 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc42Q5SV66 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc42Q5SV66 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc42Q5SV66 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc42Q5SV66 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc42Q5SV66 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc42Q5SV66 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc42Q5SV66 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc42Q5SV66 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc42Q5SV66 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc42Q5SV66 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc42Q5SV66 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc42Q5SV66 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc42Q5SV66 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc42Q5SV66 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc42Q5SV66 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc42Q5SV66 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc42Q5SV66 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc42Q5SV66 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc42Q5SV66 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc42Q5SV66 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc42Q5SV66 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc42Q5SV66 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc42Q5SV66 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc42Q5SV66 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc42Q5SV66 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc42Q5SV66 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc42Q5SV66 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc42Q5SV66 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc42Q5SV66 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc42Q5SV66 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc42Q5SV66 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc42Q5SV66 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc42Q5SV66 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Ccdc42Q5SV66 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Ccdc42Q5SV66 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Ccdc42Q5SV66 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC19.89■□□□□ 0.78
Ccdc42Q5SV66 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc42Q5SV66 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc42Q5SV66 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc42Q5SV66 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc42Q5SV66 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc42Q5SV66 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc42Q5SV66 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc42Q5SV66 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc42Q5SV66 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc42Q5SV66 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc42Q5SV66 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc42Q5SV66 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc42Q5SV66 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc42Q5SV66 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc42Q5SV66 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc42Q5SV66 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc42Q5SV66 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc42Q5SV66 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc42Q5SV66 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc42Q5SV66 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc42Q5SV66 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc42Q5SV66 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc42Q5SV66 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc42Q5SV66 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc42Q5SV66 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc42Q5SV66 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc42Q5SV66 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc42Q5SV66 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc42Q5SV66 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc42Q5SV66 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc42Q5SV66 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc42Q5SV66 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc42Q5SV66 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc42Q5SV66 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc42Q5SV66 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc42Q5SV66 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc42Q5SV66 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc42Q5SV66 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc42Q5SV66 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc42Q5SV66 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc42Q5SV66 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc42Q5SV66 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc42Q5SV66 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc42Q5SV66 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc42Q5SV66 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc42Q5SV66 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc42Q5SV66 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc42Q5SV66 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc42Q5SV66 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc42Q5SV66 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc42Q5SV66 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms