Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUC9

Sco1, Protein SCO1 homolog, mitochondrial, mousemouse

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Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sco1Q5SUC9 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sco1Q5SUC9 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sco1Q5SUC9 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sco1Q5SUC9 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sco1Q5SUC9 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sco1Q5SUC9 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sco1Q5SUC9 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sco1Q5SUC9 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sco1Q5SUC9 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sco1Q5SUC9 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sco1Q5SUC9 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sco1Q5SUC9 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sco1Q5SUC9 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sco1Q5SUC9 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sco1Q5SUC9 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sco1Q5SUC9 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sco1Q5SUC9 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sco1Q5SUC9 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sco1Q5SUC9 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sco1Q5SUC9 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sco1Q5SUC9 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sco1Q5SUC9 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sco1Q5SUC9 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sco1Q5SUC9 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sco1Q5SUC9 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sco1Q5SUC9 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sco1Q5SUC9 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sco1Q5SUC9 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sco1Q5SUC9 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sco1Q5SUC9 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sco1Q5SUC9 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sco1Q5SUC9 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sco1Q5SUC9 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sco1Q5SUC9 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Sco1Q5SUC9 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sco1Q5SUC9 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sco1Q5SUC9 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sco1Q5SUC9 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sco1Q5SUC9 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sco1Q5SUC9 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sco1Q5SUC9 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sco1Q5SUC9 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sco1Q5SUC9 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sco1Q5SUC9 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
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Sco1Q5SUC9 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sco1Q5SUC9 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
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Sco1Q5SUC9 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Sco1Q5SUC9 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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Sco1Q5SUC9 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sco1Q5SUC9 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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Sco1Q5SUC9 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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Sco1Q5SUC9 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sco1Q5SUC9 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sco1Q5SUC9 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Sco1Q5SUC9 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Sco1Q5SUC9 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sco1Q5SUC9 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sco1Q5SUC9 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sco1Q5SUC9 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
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Sco1Q5SUC9 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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Sco1Q5SUC9 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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Sco1Q5SUC9 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sco1Q5SUC9 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Sco1Q5SUC9 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sco1Q5SUC9 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sco1Q5SUC9 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sco1Q5SUC9 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
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Sco1Q5SUC9 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sco1Q5SUC9 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sco1Q5SUC9 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sco1Q5SUC9 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sco1Q5SUC9 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sco1Q5SUC9 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sco1Q5SUC9 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sco1Q5SUC9 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sco1Q5SUC9 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sco1Q5SUC9 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sco1Q5SUC9 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sco1Q5SUC9 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sco1Q5SUC9 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sco1Q5SUC9 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sco1Q5SUC9 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sco1Q5SUC9 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms