Protein–RNA interactions for Protein: Q5STT6

Fam71b, Protein FAM71B, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71bQ5STT6 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fam71bQ5STT6 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fam71bQ5STT6 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fam71bQ5STT6 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Fam71bQ5STT6 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fam71bQ5STT6 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fam71bQ5STT6 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fam71bQ5STT6 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fam71bQ5STT6 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fam71bQ5STT6 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fam71bQ5STT6 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fam71bQ5STT6 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fam71bQ5STT6 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fam71bQ5STT6 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fam71bQ5STT6 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fam71bQ5STT6 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fam71bQ5STT6 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fam71bQ5STT6 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Fam71bQ5STT6 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fam71bQ5STT6 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fam71bQ5STT6 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fam71bQ5STT6 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fam71bQ5STT6 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fam71bQ5STT6 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fam71bQ5STT6 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fam71bQ5STT6 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fam71bQ5STT6 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fam71bQ5STT6 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fam71bQ5STT6 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fam71bQ5STT6 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fam71bQ5STT6 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fam71bQ5STT6 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fam71bQ5STT6 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fam71bQ5STT6 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fam71bQ5STT6 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fam71bQ5STT6 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fam71bQ5STT6 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fam71bQ5STT6 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fam71bQ5STT6 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fam71bQ5STT6 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam71bQ5STT6 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam71bQ5STT6 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam71bQ5STT6 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam71bQ5STT6 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam71bQ5STT6 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam71bQ5STT6 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam71bQ5STT6 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam71bQ5STT6 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam71bQ5STT6 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam71bQ5STT6 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam71bQ5STT6 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam71bQ5STT6 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam71bQ5STT6 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fam71bQ5STT6 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fam71bQ5STT6 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fam71bQ5STT6 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fam71bQ5STT6 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fam71bQ5STT6 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Fam71bQ5STT6 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fam71bQ5STT6 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fam71bQ5STT6 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fam71bQ5STT6 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fam71bQ5STT6 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fam71bQ5STT6 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fam71bQ5STT6 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fam71bQ5STT6 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fam71bQ5STT6 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fam71bQ5STT6 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fam71bQ5STT6 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Fam71bQ5STT6 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fam71bQ5STT6 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fam71bQ5STT6 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fam71bQ5STT6 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fam71bQ5STT6 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fam71bQ5STT6 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fam71bQ5STT6 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fam71bQ5STT6 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fam71bQ5STT6 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fam71bQ5STT6 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fam71bQ5STT6 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fam71bQ5STT6 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fam71bQ5STT6 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fam71bQ5STT6 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fam71bQ5STT6 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fam71bQ5STT6 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fam71bQ5STT6 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fam71bQ5STT6 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fam71bQ5STT6 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fam71bQ5STT6 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fam71bQ5STT6 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fam71bQ5STT6 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fam71bQ5STT6 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fam71bQ5STT6 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fam71bQ5STT6 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fam71bQ5STT6 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fam71bQ5STT6 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fam71bQ5STT6 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam71bQ5STT6 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam71bQ5STT6 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam71bQ5STT6 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms