Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSZ7

Znrf3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, mousemouse

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znrf3Q5SSZ7 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Znrf3Q5SSZ7 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Znrf3Q5SSZ7 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Znrf3Q5SSZ7 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Znrf3Q5SSZ7 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Znrf3Q5SSZ7 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Znrf3Q5SSZ7 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Znrf3Q5SSZ7 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Znrf3Q5SSZ7 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Znrf3Q5SSZ7 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Znrf3Q5SSZ7 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Znrf3Q5SSZ7 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Znrf3Q5SSZ7 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Znrf3Q5SSZ7 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Znrf3Q5SSZ7 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Znrf3Q5SSZ7 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Znrf3Q5SSZ7 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Znrf3Q5SSZ7 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Znrf3Q5SSZ7 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Znrf3Q5SSZ7 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Znrf3Q5SSZ7 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Znrf3Q5SSZ7 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Znrf3Q5SSZ7 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Znrf3Q5SSZ7 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Znrf3Q5SSZ7 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Znrf3Q5SSZ7 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Znrf3Q5SSZ7 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Znrf3Q5SSZ7 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Znrf3Q5SSZ7 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Znrf3Q5SSZ7 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Znrf3Q5SSZ7 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Znrf3Q5SSZ7 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Znrf3Q5SSZ7 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Znrf3Q5SSZ7 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Znrf3Q5SSZ7 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Znrf3Q5SSZ7 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Znrf3Q5SSZ7 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Znrf3Q5SSZ7 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Znrf3Q5SSZ7 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Znrf3Q5SSZ7 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Znrf3Q5SSZ7 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Znrf3Q5SSZ7 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Znrf3Q5SSZ7 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Znrf3Q5SSZ7 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Znrf3Q5SSZ7 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Znrf3Q5SSZ7 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Znrf3Q5SSZ7 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Znrf3Q5SSZ7 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Znrf3Q5SSZ7 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Znrf3Q5SSZ7 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Znrf3Q5SSZ7 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Znrf3Q5SSZ7 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Znrf3Q5SSZ7 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Znrf3Q5SSZ7 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Znrf3Q5SSZ7 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Znrf3Q5SSZ7 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Znrf3Q5SSZ7 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Znrf3Q5SSZ7 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Znrf3Q5SSZ7 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Znrf3Q5SSZ7 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Znrf3Q5SSZ7 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Znrf3Q5SSZ7 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Znrf3Q5SSZ7 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Znrf3Q5SSZ7 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Znrf3Q5SSZ7 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Znrf3Q5SSZ7 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Znrf3Q5SSZ7 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Znrf3Q5SSZ7 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Znrf3Q5SSZ7 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Znrf3Q5SSZ7 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Znrf3Q5SSZ7 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Znrf3Q5SSZ7 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Znrf3Q5SSZ7 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Znrf3Q5SSZ7 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Znrf3Q5SSZ7 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Znrf3Q5SSZ7 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Znrf3Q5SSZ7 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Znrf3Q5SSZ7 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Znrf3Q5SSZ7 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Znrf3Q5SSZ7 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Znrf3Q5SSZ7 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Znrf3Q5SSZ7 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Znrf3Q5SSZ7 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Znrf3Q5SSZ7 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Znrf3Q5SSZ7 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Znrf3Q5SSZ7 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Znrf3Q5SSZ7 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Znrf3Q5SSZ7 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Znrf3Q5SSZ7 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Znrf3Q5SSZ7 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Znrf3Q5SSZ7 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Znrf3Q5SSZ7 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Znrf3Q5SSZ7 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Znrf3Q5SSZ7 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Znrf3Q5SSZ7 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Znrf3Q5SSZ7 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Znrf3Q5SSZ7 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Znrf3Q5SSZ7 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Znrf3Q5SSZ7 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Znrf3Q5SSZ7 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms