Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sft2d1Q5SSN7 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Sft2d1Q5SSN7 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sft2d1Q5SSN7 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sft2d1Q5SSN7 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sft2d1Q5SSN7 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sft2d1Q5SSN7 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sft2d1Q5SSN7 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sft2d1Q5SSN7 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sft2d1Q5SSN7 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sft2d1Q5SSN7 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Sft2d1Q5SSN7 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sft2d1Q5SSN7 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sft2d1Q5SSN7 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Sft2d1Q5SSN7 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sft2d1Q5SSN7 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Sft2d1Q5SSN7 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sft2d1Q5SSN7 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sft2d1Q5SSN7 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Sft2d1Q5SSN7 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sft2d1Q5SSN7 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sft2d1Q5SSN7 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sft2d1Q5SSN7 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sft2d1Q5SSN7 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sft2d1Q5SSN7 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sft2d1Q5SSN7 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sft2d1Q5SSN7 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sft2d1Q5SSN7 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Sft2d1Q5SSN7 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sft2d1Q5SSN7 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sft2d1Q5SSN7 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sft2d1Q5SSN7 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sft2d1Q5SSN7 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sft2d1Q5SSN7 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sft2d1Q5SSN7 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sft2d1Q5SSN7 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sft2d1Q5SSN7 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sft2d1Q5SSN7 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sft2d1Q5SSN7 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sft2d1Q5SSN7 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Sft2d1Q5SSN7 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sft2d1Q5SSN7 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sft2d1Q5SSN7 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sft2d1Q5SSN7 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sft2d1Q5SSN7 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sft2d1Q5SSN7 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sft2d1Q5SSN7 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sft2d1Q5SSN7 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sft2d1Q5SSN7 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sft2d1Q5SSN7 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sft2d1Q5SSN7 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sft2d1Q5SSN7 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sft2d1Q5SSN7 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Sft2d1Q5SSN7 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sft2d1Q5SSN7 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sft2d1Q5SSN7 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sft2d1Q5SSN7 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sft2d1Q5SSN7 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sft2d1Q5SSN7 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sft2d1Q5SSN7 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sft2d1Q5SSN7 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sft2d1Q5SSN7 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sft2d1Q5SSN7 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sft2d1Q5SSN7 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sft2d1Q5SSN7 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sft2d1Q5SSN7 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sft2d1Q5SSN7 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sft2d1Q5SSN7 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sft2d1Q5SSN7 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Sft2d1Q5SSN7 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sft2d1Q5SSN7 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Sft2d1Q5SSN7 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sft2d1Q5SSN7 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sft2d1Q5SSN7 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sft2d1Q5SSN7 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sft2d1Q5SSN7 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sft2d1Q5SSN7 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sft2d1Q5SSN7 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sft2d1Q5SSN7 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sft2d1Q5SSN7 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sft2d1Q5SSN7 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sft2d1Q5SSN7 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sft2d1Q5SSN7 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sft2d1Q5SSN7 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sft2d1Q5SSN7 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sft2d1Q5SSN7 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sft2d1Q5SSN7 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sft2d1Q5SSN7 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sft2d1Q5SSN7 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sft2d1Q5SSN7 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sft2d1Q5SSN7 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sft2d1Q5SSN7 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Sft2d1Q5SSN7 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sft2d1Q5SSN7 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sft2d1Q5SSN7 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sft2d1Q5SSN7 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sft2d1Q5SSN7 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sft2d1Q5SSN7 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sft2d1Q5SSN7 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sft2d1Q5SSN7 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms