Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSL4

Abr, Active breakpoint cluster region-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AbrQ5SSL4 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AbrQ5SSL4 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AbrQ5SSL4 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AbrQ5SSL4 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AbrQ5SSL4 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AbrQ5SSL4 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AbrQ5SSL4 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AbrQ5SSL4 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AbrQ5SSL4 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
AbrQ5SSL4 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AbrQ5SSL4 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
AbrQ5SSL4 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AbrQ5SSL4 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AbrQ5SSL4 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AbrQ5SSL4 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AbrQ5SSL4 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AbrQ5SSL4 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AbrQ5SSL4 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AbrQ5SSL4 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AbrQ5SSL4 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AbrQ5SSL4 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AbrQ5SSL4 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AbrQ5SSL4 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AbrQ5SSL4 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AbrQ5SSL4 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AbrQ5SSL4 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AbrQ5SSL4 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AbrQ5SSL4 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AbrQ5SSL4 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AbrQ5SSL4 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AbrQ5SSL4 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AbrQ5SSL4 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
AbrQ5SSL4 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AbrQ5SSL4 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
AbrQ5SSL4 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
AbrQ5SSL4 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
AbrQ5SSL4 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
AbrQ5SSL4 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
AbrQ5SSL4 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
AbrQ5SSL4 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
AbrQ5SSL4 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
AbrQ5SSL4 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
AbrQ5SSL4 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
AbrQ5SSL4 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
AbrQ5SSL4 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AbrQ5SSL4 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
AbrQ5SSL4 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AbrQ5SSL4 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
AbrQ5SSL4 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AbrQ5SSL4 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AbrQ5SSL4 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AbrQ5SSL4 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AbrQ5SSL4 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AbrQ5SSL4 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AbrQ5SSL4 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AbrQ5SSL4 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AbrQ5SSL4 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AbrQ5SSL4 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AbrQ5SSL4 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AbrQ5SSL4 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
AbrQ5SSL4 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AbrQ5SSL4 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AbrQ5SSL4 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AbrQ5SSL4 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AbrQ5SSL4 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AbrQ5SSL4 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
AbrQ5SSL4 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AbrQ5SSL4 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AbrQ5SSL4 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AbrQ5SSL4 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AbrQ5SSL4 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AbrQ5SSL4 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AbrQ5SSL4 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AbrQ5SSL4 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AbrQ5SSL4 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AbrQ5SSL4 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AbrQ5SSL4 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AbrQ5SSL4 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AbrQ5SSL4 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AbrQ5SSL4 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AbrQ5SSL4 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AbrQ5SSL4 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
AbrQ5SSL4 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
AbrQ5SSL4 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AbrQ5SSL4 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
AbrQ5SSL4 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
AbrQ5SSL4 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
AbrQ5SSL4 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
AbrQ5SSL4 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AbrQ5SSL4 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AbrQ5SSL4 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AbrQ5SSL4 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AbrQ5SSL4 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AbrQ5SSL4 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AbrQ5SSL4 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
AbrQ5SSL4 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
AbrQ5SSL4 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
AbrQ5SSL4 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AbrQ5SSL4 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AbrQ5SSL4 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms