Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPL2

Phf12, PHD finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf12Q5SPL2 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Phf12Q5SPL2 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Phf12Q5SPL2 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Phf12Q5SPL2 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Phf12Q5SPL2 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Phf12Q5SPL2 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Phf12Q5SPL2 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Phf12Q5SPL2 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Phf12Q5SPL2 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Phf12Q5SPL2 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Phf12Q5SPL2 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Phf12Q5SPL2 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Phf12Q5SPL2 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Phf12Q5SPL2 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Phf12Q5SPL2 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Phf12Q5SPL2 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Phf12Q5SPL2 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Phf12Q5SPL2 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Phf12Q5SPL2 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Phf12Q5SPL2 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Phf12Q5SPL2 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Phf12Q5SPL2 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Phf12Q5SPL2 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Phf12Q5SPL2 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Phf12Q5SPL2 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Phf12Q5SPL2 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Phf12Q5SPL2 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Phf12Q5SPL2 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Phf12Q5SPL2 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Phf12Q5SPL2 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Phf12Q5SPL2 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Phf12Q5SPL2 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Phf12Q5SPL2 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Phf12Q5SPL2 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Phf12Q5SPL2 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Phf12Q5SPL2 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Phf12Q5SPL2 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Phf12Q5SPL2 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Phf12Q5SPL2 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Phf12Q5SPL2 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Phf12Q5SPL2 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Phf12Q5SPL2 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Phf12Q5SPL2 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Phf12Q5SPL2 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Phf12Q5SPL2 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Phf12Q5SPL2 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Phf12Q5SPL2 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Phf12Q5SPL2 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Phf12Q5SPL2 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Phf12Q5SPL2 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Phf12Q5SPL2 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Phf12Q5SPL2 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Phf12Q5SPL2 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Phf12Q5SPL2 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Phf12Q5SPL2 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Phf12Q5SPL2 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Phf12Q5SPL2 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Phf12Q5SPL2 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Phf12Q5SPL2 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Phf12Q5SPL2 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Phf12Q5SPL2 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Phf12Q5SPL2 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Phf12Q5SPL2 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Phf12Q5SPL2 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Phf12Q5SPL2 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Phf12Q5SPL2 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Phf12Q5SPL2 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Phf12Q5SPL2 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Phf12Q5SPL2 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Phf12Q5SPL2 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Phf12Q5SPL2 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Phf12Q5SPL2 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Phf12Q5SPL2 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Phf12Q5SPL2 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Phf12Q5SPL2 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Phf12Q5SPL2 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Phf12Q5SPL2 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Phf12Q5SPL2 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Phf12Q5SPL2 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Phf12Q5SPL2 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Phf12Q5SPL2 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Phf12Q5SPL2 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Phf12Q5SPL2 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Phf12Q5SPL2 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Phf12Q5SPL2 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Phf12Q5SPL2 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Phf12Q5SPL2 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Phf12Q5SPL2 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Phf12Q5SPL2 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Phf12Q5SPL2 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Phf12Q5SPL2 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Phf12Q5SPL2 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Phf12Q5SPL2 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Phf12Q5SPL2 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Phf12Q5SPL2 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Phf12Q5SPL2 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Phf12Q5SPL2 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Phf12Q5SPL2 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Phf12Q5SPL2 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Phf12Q5SPL2 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 189.8 ms