Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJB0

Bhlha9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlha9Q5RJB0 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bhlha9Q5RJB0 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bhlha9Q5RJB0 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Bhlha9Q5RJB0 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Bhlha9Q5RJB0 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Bhlha9Q5RJB0 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Bhlha9Q5RJB0 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Bhlha9Q5RJB0 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Bhlha9Q5RJB0 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Bhlha9Q5RJB0 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Bhlha9Q5RJB0 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Bhlha9Q5RJB0 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Bhlha9Q5RJB0 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Bhlha9Q5RJB0 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Bhlha9Q5RJB0 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Bhlha9Q5RJB0 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Bhlha9Q5RJB0 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Bhlha9Q5RJB0 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Bhlha9Q5RJB0 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Bhlha9Q5RJB0 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Bhlha9Q5RJB0 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Bhlha9Q5RJB0 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Bhlha9Q5RJB0 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Bhlha9Q5RJB0 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Bhlha9Q5RJB0 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Bhlha9Q5RJB0 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Bhlha9Q5RJB0 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Bhlha9Q5RJB0 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Bhlha9Q5RJB0 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Bhlha9Q5RJB0 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Bhlha9Q5RJB0 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Bhlha9Q5RJB0 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Bhlha9Q5RJB0 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Bhlha9Q5RJB0 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Bhlha9Q5RJB0 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Bhlha9Q5RJB0 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Bhlha9Q5RJB0 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Bhlha9Q5RJB0 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Bhlha9Q5RJB0 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Bhlha9Q5RJB0 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Bhlha9Q5RJB0 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Bhlha9Q5RJB0 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Bhlha9Q5RJB0 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Bhlha9Q5RJB0 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Bhlha9Q5RJB0 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Bhlha9Q5RJB0 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Bhlha9Q5RJB0 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Bhlha9Q5RJB0 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Bhlha9Q5RJB0 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Bhlha9Q5RJB0 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Bhlha9Q5RJB0 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Bhlha9Q5RJB0 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Bhlha9Q5RJB0 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Bhlha9Q5RJB0 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Bhlha9Q5RJB0 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Bhlha9Q5RJB0 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bhlha9Q5RJB0 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bhlha9Q5RJB0 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bhlha9Q5RJB0 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bhlha9Q5RJB0 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bhlha9Q5RJB0 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bhlha9Q5RJB0 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bhlha9Q5RJB0 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bhlha9Q5RJB0 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bhlha9Q5RJB0 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bhlha9Q5RJB0 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bhlha9Q5RJB0 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bhlha9Q5RJB0 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bhlha9Q5RJB0 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bhlha9Q5RJB0 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bhlha9Q5RJB0 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bhlha9Q5RJB0 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bhlha9Q5RJB0 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bhlha9Q5RJB0 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bhlha9Q5RJB0 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Bhlha9Q5RJB0 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Bhlha9Q5RJB0 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Bhlha9Q5RJB0 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Bhlha9Q5RJB0 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Bhlha9Q5RJB0 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Bhlha9Q5RJB0 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Bhlha9Q5RJB0 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Bhlha9Q5RJB0 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Bhlha9Q5RJB0 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Bhlha9Q5RJB0 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Bhlha9Q5RJB0 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Bhlha9Q5RJB0 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Bhlha9Q5RJB0 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Bhlha9Q5RJB0 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Bhlha9Q5RJB0 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Bhlha9Q5RJB0 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Bhlha9Q5RJB0 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Bhlha9Q5RJB0 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Bhlha9Q5RJB0 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Bhlha9Q5RJB0 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Bhlha9Q5RJB0 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Bhlha9Q5RJB0 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Bhlha9Q5RJB0 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Bhlha9Q5RJB0 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Bhlha9Q5RJB0 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms