Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A3

Trdv4, T cell receptor delta variable 4 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv4Q5R1A3 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trdv4Q5R1A3 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trdv4Q5R1A3 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trdv4Q5R1A3 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trdv4Q5R1A3 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trdv4Q5R1A3 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trdv4Q5R1A3 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trdv4Q5R1A3 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trdv4Q5R1A3 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Trdv4Q5R1A3 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trdv4Q5R1A3 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trdv4Q5R1A3 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trdv4Q5R1A3 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trdv4Q5R1A3 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trdv4Q5R1A3 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trdv4Q5R1A3 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trdv4Q5R1A3 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trdv4Q5R1A3 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trdv4Q5R1A3 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Trdv4Q5R1A3 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trdv4Q5R1A3 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Trdv4Q5R1A3 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trdv4Q5R1A3 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trdv4Q5R1A3 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trdv4Q5R1A3 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trdv4Q5R1A3 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Trdv4Q5R1A3 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trdv4Q5R1A3 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trdv4Q5R1A3 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trdv4Q5R1A3 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trdv4Q5R1A3 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trdv4Q5R1A3 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trdv4Q5R1A3 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Trdv4Q5R1A3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trdv4Q5R1A3 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trdv4Q5R1A3 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trdv4Q5R1A3 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trdv4Q5R1A3 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trdv4Q5R1A3 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trdv4Q5R1A3 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trdv4Q5R1A3 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trdv4Q5R1A3 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trdv4Q5R1A3 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trdv4Q5R1A3 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trdv4Q5R1A3 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trdv4Q5R1A3 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trdv4Q5R1A3 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trdv4Q5R1A3 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trdv4Q5R1A3 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trdv4Q5R1A3 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trdv4Q5R1A3 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trdv4Q5R1A3 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Trdv4Q5R1A3 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trdv4Q5R1A3 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trdv4Q5R1A3 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Trdv4Q5R1A3 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trdv4Q5R1A3 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trdv4Q5R1A3 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trdv4Q5R1A3 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trdv4Q5R1A3 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trdv4Q5R1A3 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Trdv4Q5R1A3 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trdv4Q5R1A3 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trdv4Q5R1A3 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trdv4Q5R1A3 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trdv4Q5R1A3 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Trdv4Q5R1A3 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trdv4Q5R1A3 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trdv4Q5R1A3 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trdv4Q5R1A3 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trdv4Q5R1A3 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trdv4Q5R1A3 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trdv4Q5R1A3 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trdv4Q5R1A3 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trdv4Q5R1A3 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trdv4Q5R1A3 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trdv4Q5R1A3 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trdv4Q5R1A3 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trdv4Q5R1A3 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Trdv4Q5R1A3 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trdv4Q5R1A3 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trdv4Q5R1A3 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trdv4Q5R1A3 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trdv4Q5R1A3 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Trdv4Q5R1A3 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trdv4Q5R1A3 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trdv4Q5R1A3 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trdv4Q5R1A3 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trdv4Q5R1A3 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trdv4Q5R1A3 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trdv4Q5R1A3 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trdv4Q5R1A3 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trdv4Q5R1A3 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trdv4Q5R1A3 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trdv4Q5R1A3 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trdv4Q5R1A3 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trdv4Q5R1A3 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trdv4Q5R1A3 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trdv4Q5R1A3 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trdv4Q5R1A3 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms