Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCJ1

Rapgef6, Rap guanine nucleotide exchange factor (GEF) 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef6Q5NCJ1 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Rapgef6Q5NCJ1 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rapgef6Q5NCJ1 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rapgef6Q5NCJ1 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rapgef6Q5NCJ1 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Rapgef6Q5NCJ1 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Rapgef6Q5NCJ1 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rapgef6Q5NCJ1 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rapgef6Q5NCJ1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rapgef6Q5NCJ1 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rapgef6Q5NCJ1 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rapgef6Q5NCJ1 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rapgef6Q5NCJ1 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rapgef6Q5NCJ1 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rapgef6Q5NCJ1 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rapgef6Q5NCJ1 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rapgef6Q5NCJ1 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rapgef6Q5NCJ1 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rapgef6Q5NCJ1 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rapgef6Q5NCJ1 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rapgef6Q5NCJ1 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rapgef6Q5NCJ1 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rapgef6Q5NCJ1 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rapgef6Q5NCJ1 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rapgef6Q5NCJ1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rapgef6Q5NCJ1 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Rapgef6Q5NCJ1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rapgef6Q5NCJ1 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rapgef6Q5NCJ1 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rapgef6Q5NCJ1 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Rapgef6Q5NCJ1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rapgef6Q5NCJ1 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rapgef6Q5NCJ1 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rapgef6Q5NCJ1 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rapgef6Q5NCJ1 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rapgef6Q5NCJ1 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rapgef6Q5NCJ1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rapgef6Q5NCJ1 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rapgef6Q5NCJ1 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rapgef6Q5NCJ1 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rapgef6Q5NCJ1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rapgef6Q5NCJ1 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rapgef6Q5NCJ1 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rapgef6Q5NCJ1 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Rapgef6Q5NCJ1 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rapgef6Q5NCJ1 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rapgef6Q5NCJ1 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rapgef6Q5NCJ1 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rapgef6Q5NCJ1 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rapgef6Q5NCJ1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rapgef6Q5NCJ1 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rapgef6Q5NCJ1 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rapgef6Q5NCJ1 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
Rapgef6Q5NCJ1 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
Rapgef6Q5NCJ1 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rapgef6Q5NCJ1 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rapgef6Q5NCJ1 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rapgef6Q5NCJ1 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rapgef6Q5NCJ1 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rapgef6Q5NCJ1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rapgef6Q5NCJ1 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rapgef6Q5NCJ1 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rapgef6Q5NCJ1 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rapgef6Q5NCJ1 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Rapgef6Q5NCJ1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rapgef6Q5NCJ1 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rapgef6Q5NCJ1 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rapgef6Q5NCJ1 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rapgef6Q5NCJ1 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rapgef6Q5NCJ1 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rapgef6Q5NCJ1 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rapgef6Q5NCJ1 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rapgef6Q5NCJ1 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rapgef6Q5NCJ1 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rapgef6Q5NCJ1 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rapgef6Q5NCJ1 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Rapgef6Q5NCJ1 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Rapgef6Q5NCJ1 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rapgef6Q5NCJ1 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rapgef6Q5NCJ1 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rapgef6Q5NCJ1 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rapgef6Q5NCJ1 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rapgef6Q5NCJ1 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Rapgef6Q5NCJ1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rapgef6Q5NCJ1 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rapgef6Q5NCJ1 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rapgef6Q5NCJ1 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Rapgef6Q5NCJ1 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rapgef6Q5NCJ1 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rapgef6Q5NCJ1 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Rapgef6Q5NCJ1 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rapgef6Q5NCJ1 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rapgef6Q5NCJ1 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rapgef6Q5NCJ1 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rapgef6Q5NCJ1 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Rapgef6Q5NCJ1 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Rapgef6Q5NCJ1 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Rapgef6Q5NCJ1 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Rapgef6Q5NCJ1 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Rapgef6Q5NCJ1 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms