Protein–RNA interactions for Protein: Q5EG47

Prkaa1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkaa1Q5EG47 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Prkaa1Q5EG47 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Prkaa1Q5EG47 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Prkaa1Q5EG47 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Prkaa1Q5EG47 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Prkaa1Q5EG47 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Prkaa1Q5EG47 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Prkaa1Q5EG47 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Prkaa1Q5EG47 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Prkaa1Q5EG47 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Prkaa1Q5EG47 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Prkaa1Q5EG47 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Prkaa1Q5EG47 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Prkaa1Q5EG47 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Prkaa1Q5EG47 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Prkaa1Q5EG47 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Prkaa1Q5EG47 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Prkaa1Q5EG47 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Prkaa1Q5EG47 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Prkaa1Q5EG47 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Prkaa1Q5EG47 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Prkaa1Q5EG47 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Prkaa1Q5EG47 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Prkaa1Q5EG47 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Prkaa1Q5EG47 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Prkaa1Q5EG47 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Prkaa1Q5EG47 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Prkaa1Q5EG47 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Prkaa1Q5EG47 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Prkaa1Q5EG47 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Prkaa1Q5EG47 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Prkaa1Q5EG47 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Prkaa1Q5EG47 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Prkaa1Q5EG47 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Prkaa1Q5EG47 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Prkaa1Q5EG47 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Prkaa1Q5EG47 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Prkaa1Q5EG47 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Prkaa1Q5EG47 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Prkaa1Q5EG47 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Prkaa1Q5EG47 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Prkaa1Q5EG47 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Prkaa1Q5EG47 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Prkaa1Q5EG47 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Prkaa1Q5EG47 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Prkaa1Q5EG47 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Prkaa1Q5EG47 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Prkaa1Q5EG47 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Prkaa1Q5EG47 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Prkaa1Q5EG47 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Prkaa1Q5EG47 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Prkaa1Q5EG47 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Prkaa1Q5EG47 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Prkaa1Q5EG47 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Prkaa1Q5EG47 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Prkaa1Q5EG47 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Prkaa1Q5EG47 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Prkaa1Q5EG47 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Prkaa1Q5EG47 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Prkaa1Q5EG47 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Prkaa1Q5EG47 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Prkaa1Q5EG47 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Prkaa1Q5EG47 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Prkaa1Q5EG47 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Prkaa1Q5EG47 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Prkaa1Q5EG47 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Prkaa1Q5EG47 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Prkaa1Q5EG47 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Prkaa1Q5EG47 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Prkaa1Q5EG47 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Prkaa1Q5EG47 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Prkaa1Q5EG47 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Prkaa1Q5EG47 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Prkaa1Q5EG47 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Prkaa1Q5EG47 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Prkaa1Q5EG47 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Prkaa1Q5EG47 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Prkaa1Q5EG47 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Prkaa1Q5EG47 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Prkaa1Q5EG47 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Prkaa1Q5EG47 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
Prkaa1Q5EG47 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Prkaa1Q5EG47 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Prkaa1Q5EG47 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Prkaa1Q5EG47 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prkaa1Q5EG47 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prkaa1Q5EG47 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Prkaa1Q5EG47 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prkaa1Q5EG47 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prkaa1Q5EG47 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prkaa1Q5EG47 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prkaa1Q5EG47 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prkaa1Q5EG47 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prkaa1Q5EG47 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prkaa1Q5EG47 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Prkaa1Q5EG47 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prkaa1Q5EG47 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prkaa1Q5EG47 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prkaa1Q5EG47 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prkaa1Q5EG47 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms