Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU41

Lrrc8b, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8B, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc8bQ5DU41 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrc8bQ5DU41 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrc8bQ5DU41 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrc8bQ5DU41 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrc8bQ5DU41 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrc8bQ5DU41 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrc8bQ5DU41 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrc8bQ5DU41 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrc8bQ5DU41 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrc8bQ5DU41 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrc8bQ5DU41 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrc8bQ5DU41 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrc8bQ5DU41 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrc8bQ5DU41 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrc8bQ5DU41 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrc8bQ5DU41 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrc8bQ5DU41 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrc8bQ5DU41 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrc8bQ5DU41 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrc8bQ5DU41 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrc8bQ5DU41 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrc8bQ5DU41 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrc8bQ5DU41 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrc8bQ5DU41 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrc8bQ5DU41 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrc8bQ5DU41 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrc8bQ5DU41 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrc8bQ5DU41 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrc8bQ5DU41 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrc8bQ5DU41 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrc8bQ5DU41 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrc8bQ5DU41 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrc8bQ5DU41 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrc8bQ5DU41 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrc8bQ5DU41 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrc8bQ5DU41 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrc8bQ5DU41 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrc8bQ5DU41 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrc8bQ5DU41 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrc8bQ5DU41 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrc8bQ5DU41 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrc8bQ5DU41 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrc8bQ5DU41 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrc8bQ5DU41 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrc8bQ5DU41 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrc8bQ5DU41 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrc8bQ5DU41 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrc8bQ5DU41 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrc8bQ5DU41 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrc8bQ5DU41 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrc8bQ5DU41 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrc8bQ5DU41 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrc8bQ5DU41 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrc8bQ5DU41 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrc8bQ5DU41 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrc8bQ5DU41 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrc8bQ5DU41 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrc8bQ5DU41 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrc8bQ5DU41 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrc8bQ5DU41 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrc8bQ5DU41 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrc8bQ5DU41 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrc8bQ5DU41 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrc8bQ5DU41 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrc8bQ5DU41 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrc8bQ5DU41 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrc8bQ5DU41 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrc8bQ5DU41 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrc8bQ5DU41 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrc8bQ5DU41 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrc8bQ5DU41 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrc8bQ5DU41 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrc8bQ5DU41 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrc8bQ5DU41 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrc8bQ5DU41 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrc8bQ5DU41 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrc8bQ5DU41 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrc8bQ5DU41 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrc8bQ5DU41 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrc8bQ5DU41 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrc8bQ5DU41 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrc8bQ5DU41 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrc8bQ5DU41 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrc8bQ5DU41 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrc8bQ5DU41 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrc8bQ5DU41 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrc8bQ5DU41 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrc8bQ5DU41 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrc8bQ5DU41 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrc8bQ5DU41 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrc8bQ5DU41 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrc8bQ5DU41 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrc8bQ5DU41 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrc8bQ5DU41 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrc8bQ5DU41 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrc8bQ5DU41 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrc8bQ5DU41 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrrc8bQ5DU41 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrrc8bQ5DU41 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrrc8bQ5DU41 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms