Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU02

Usp22, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 22, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp22Q5DU02 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp22Q5DU02 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp22Q5DU02 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp22Q5DU02 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp22Q5DU02 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp22Q5DU02 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp22Q5DU02 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp22Q5DU02 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp22Q5DU02 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp22Q5DU02 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp22Q5DU02 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp22Q5DU02 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp22Q5DU02 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp22Q5DU02 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp22Q5DU02 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp22Q5DU02 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp22Q5DU02 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp22Q5DU02 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp22Q5DU02 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp22Q5DU02 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp22Q5DU02 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp22Q5DU02 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp22Q5DU02 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp22Q5DU02 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp22Q5DU02 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp22Q5DU02 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp22Q5DU02 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp22Q5DU02 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp22Q5DU02 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp22Q5DU02 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp22Q5DU02 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp22Q5DU02 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp22Q5DU02 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp22Q5DU02 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp22Q5DU02 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp22Q5DU02 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp22Q5DU02 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp22Q5DU02 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp22Q5DU02 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp22Q5DU02 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp22Q5DU02 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp22Q5DU02 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp22Q5DU02 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp22Q5DU02 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp22Q5DU02 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp22Q5DU02 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp22Q5DU02 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp22Q5DU02 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp22Q5DU02 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp22Q5DU02 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp22Q5DU02 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp22Q5DU02 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp22Q5DU02 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp22Q5DU02 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp22Q5DU02 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp22Q5DU02 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp22Q5DU02 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp22Q5DU02 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp22Q5DU02 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp22Q5DU02 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp22Q5DU02 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp22Q5DU02 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp22Q5DU02 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp22Q5DU02 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp22Q5DU02 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Usp22Q5DU02 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Usp22Q5DU02 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp22Q5DU02 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp22Q5DU02 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp22Q5DU02 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp22Q5DU02 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp22Q5DU02 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp22Q5DU02 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp22Q5DU02 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp22Q5DU02 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp22Q5DU02 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp22Q5DU02 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp22Q5DU02 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp22Q5DU02 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp22Q5DU02 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp22Q5DU02 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp22Q5DU02 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp22Q5DU02 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp22Q5DU02 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp22Q5DU02 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp22Q5DU02 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp22Q5DU02 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp22Q5DU02 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp22Q5DU02 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp22Q5DU02 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp22Q5DU02 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp22Q5DU02 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp22Q5DU02 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp22Q5DU02 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp22Q5DU02 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp22Q5DU02 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp22Q5DU02 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp22Q5DU02 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp22Q5DU02 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp22Q5DU02 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms