Protein–RNA interactions for Protein: Q58FA4

E2f8, Transcription factor E2F8, mousemouse

Predictions only

Length 860 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f8Q58FA4 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
E2f8Q58FA4 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
E2f8Q58FA4 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
E2f8Q58FA4 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
E2f8Q58FA4 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
E2f8Q58FA4 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
E2f8Q58FA4 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
E2f8Q58FA4 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
E2f8Q58FA4 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
E2f8Q58FA4 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
E2f8Q58FA4 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
E2f8Q58FA4 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
E2f8Q58FA4 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
E2f8Q58FA4 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
E2f8Q58FA4 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
E2f8Q58FA4 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
E2f8Q58FA4 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
E2f8Q58FA4 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
E2f8Q58FA4 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
E2f8Q58FA4 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
E2f8Q58FA4 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
E2f8Q58FA4 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
E2f8Q58FA4 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
E2f8Q58FA4 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
E2f8Q58FA4 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
E2f8Q58FA4 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
E2f8Q58FA4 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
E2f8Q58FA4 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
E2f8Q58FA4 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
E2f8Q58FA4 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
E2f8Q58FA4 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
E2f8Q58FA4 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
E2f8Q58FA4 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
E2f8Q58FA4 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
E2f8Q58FA4 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
E2f8Q58FA4 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
E2f8Q58FA4 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
E2f8Q58FA4 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
E2f8Q58FA4 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
E2f8Q58FA4 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
E2f8Q58FA4 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
E2f8Q58FA4 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
E2f8Q58FA4 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
E2f8Q58FA4 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
E2f8Q58FA4 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
E2f8Q58FA4 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
E2f8Q58FA4 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
E2f8Q58FA4 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
E2f8Q58FA4 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
E2f8Q58FA4 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
E2f8Q58FA4 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
E2f8Q58FA4 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
E2f8Q58FA4 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
E2f8Q58FA4 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
E2f8Q58FA4 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
E2f8Q58FA4 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
E2f8Q58FA4 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
E2f8Q58FA4 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
E2f8Q58FA4 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
E2f8Q58FA4 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
E2f8Q58FA4 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
E2f8Q58FA4 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
E2f8Q58FA4 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
E2f8Q58FA4 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
E2f8Q58FA4 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
E2f8Q58FA4 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
E2f8Q58FA4 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
E2f8Q58FA4 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
E2f8Q58FA4 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
E2f8Q58FA4 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
E2f8Q58FA4 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
E2f8Q58FA4 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
E2f8Q58FA4 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
E2f8Q58FA4 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
E2f8Q58FA4 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
E2f8Q58FA4 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
E2f8Q58FA4 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
E2f8Q58FA4 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
E2f8Q58FA4 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
E2f8Q58FA4 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
E2f8Q58FA4 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
E2f8Q58FA4 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
E2f8Q58FA4 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
E2f8Q58FA4 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
E2f8Q58FA4 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
E2f8Q58FA4 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
E2f8Q58FA4 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
E2f8Q58FA4 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
E2f8Q58FA4 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
E2f8Q58FA4 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
E2f8Q58FA4 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
E2f8Q58FA4 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
E2f8Q58FA4 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
E2f8Q58FA4 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
E2f8Q58FA4 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
E2f8Q58FA4 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
E2f8Q58FA4 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
E2f8Q58FA4 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
E2f8Q58FA4 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
E2f8Q58FA4 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms