Protein–RNA interactions for Protein: Q56A10

Znf608, Zinc finger protein 608, mousemouse

Predictions only

Length 1,511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf608Q56A10 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Znf608Q56A10 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Znf608Q56A10 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Znf608Q56A10 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Znf608Q56A10 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Znf608Q56A10 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Znf608Q56A10 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Znf608Q56A10 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Znf608Q56A10 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Znf608Q56A10 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Znf608Q56A10 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Znf608Q56A10 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Znf608Q56A10 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Znf608Q56A10 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Znf608Q56A10 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Znf608Q56A10 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Znf608Q56A10 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Znf608Q56A10 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Znf608Q56A10 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Znf608Q56A10 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Znf608Q56A10 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Znf608Q56A10 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Znf608Q56A10 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Znf608Q56A10 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Znf608Q56A10 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Znf608Q56A10 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Znf608Q56A10 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Znf608Q56A10 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Znf608Q56A10 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Znf608Q56A10 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Znf608Q56A10 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Znf608Q56A10 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Znf608Q56A10 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Znf608Q56A10 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Znf608Q56A10 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Znf608Q56A10 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Znf608Q56A10 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Znf608Q56A10 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Znf608Q56A10 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Znf608Q56A10 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Znf608Q56A10 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Znf608Q56A10 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Znf608Q56A10 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Znf608Q56A10 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Znf608Q56A10 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Znf608Q56A10 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Znf608Q56A10 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Znf608Q56A10 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Znf608Q56A10 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Znf608Q56A10 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Znf608Q56A10 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Znf608Q56A10 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Znf608Q56A10 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Znf608Q56A10 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Znf608Q56A10 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Znf608Q56A10 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Znf608Q56A10 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Znf608Q56A10 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Znf608Q56A10 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Znf608Q56A10 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Znf608Q56A10 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Znf608Q56A10 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Znf608Q56A10 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Znf608Q56A10 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Znf608Q56A10 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Znf608Q56A10 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Znf608Q56A10 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Znf608Q56A10 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Znf608Q56A10 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Znf608Q56A10 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Znf608Q56A10 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Znf608Q56A10 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Znf608Q56A10 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Znf608Q56A10 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Znf608Q56A10 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Znf608Q56A10 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Znf608Q56A10 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Znf608Q56A10 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Znf608Q56A10 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Znf608Q56A10 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Znf608Q56A10 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Znf608Q56A10 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Znf608Q56A10 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Znf608Q56A10 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Znf608Q56A10 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Znf608Q56A10 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Znf608Q56A10 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Znf608Q56A10 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Znf608Q56A10 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Znf608Q56A10 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Znf608Q56A10 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Znf608Q56A10 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Znf608Q56A10 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Znf608Q56A10 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Znf608Q56A10 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Znf608Q56A10 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Znf608Q56A10 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Znf608Q56A10 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Znf608Q56A10 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Znf608Q56A10 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.5 ms