Protein–RNA interactions for Protein: Q569L8

Cenpj, Centromere protein J, mousemouse

Predictions only

Length 1,344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpjQ569L8 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CenpjQ569L8 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CenpjQ569L8 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CenpjQ569L8 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CenpjQ569L8 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CenpjQ569L8 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CenpjQ569L8 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CenpjQ569L8 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CenpjQ569L8 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CenpjQ569L8 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CenpjQ569L8 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CenpjQ569L8 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CenpjQ569L8 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CenpjQ569L8 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CenpjQ569L8 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CenpjQ569L8 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CenpjQ569L8 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CenpjQ569L8 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CenpjQ569L8 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CenpjQ569L8 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CenpjQ569L8 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CenpjQ569L8 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CenpjQ569L8 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CenpjQ569L8 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CenpjQ569L8 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CenpjQ569L8 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CenpjQ569L8 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CenpjQ569L8 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CenpjQ569L8 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CenpjQ569L8 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CenpjQ569L8 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CenpjQ569L8 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CenpjQ569L8 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CenpjQ569L8 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CenpjQ569L8 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CenpjQ569L8 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CenpjQ569L8 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CenpjQ569L8 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CenpjQ569L8 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CenpjQ569L8 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CenpjQ569L8 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CenpjQ569L8 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CenpjQ569L8 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CenpjQ569L8 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CenpjQ569L8 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CenpjQ569L8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CenpjQ569L8 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CenpjQ569L8 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CenpjQ569L8 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CenpjQ569L8 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CenpjQ569L8 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CenpjQ569L8 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CenpjQ569L8 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CenpjQ569L8 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CenpjQ569L8 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CenpjQ569L8 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CenpjQ569L8 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CenpjQ569L8 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CenpjQ569L8 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CenpjQ569L8 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CenpjQ569L8 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CenpjQ569L8 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CenpjQ569L8 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CenpjQ569L8 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CenpjQ569L8 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CenpjQ569L8 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CenpjQ569L8 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CenpjQ569L8 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CenpjQ569L8 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CenpjQ569L8 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CenpjQ569L8 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CenpjQ569L8 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CenpjQ569L8 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CenpjQ569L8 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CenpjQ569L8 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CenpjQ569L8 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CenpjQ569L8 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CenpjQ569L8 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CenpjQ569L8 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CenpjQ569L8 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CenpjQ569L8 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CenpjQ569L8 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CenpjQ569L8 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CenpjQ569L8 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CenpjQ569L8 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CenpjQ569L8 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CenpjQ569L8 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CenpjQ569L8 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CenpjQ569L8 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CenpjQ569L8 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CenpjQ569L8 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CenpjQ569L8 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CenpjQ569L8 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CenpjQ569L8 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CenpjQ569L8 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CenpjQ569L8 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CenpjQ569L8 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CenpjQ569L8 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CenpjQ569L8 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CenpjQ569L8 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms