Protein–RNA interactions for Protein: Q52KR3

Prune2, Protein prune homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,084 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prune2Q52KR3 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prune2Q52KR3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prune2Q52KR3 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prune2Q52KR3 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prune2Q52KR3 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Prune2Q52KR3 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Prune2Q52KR3 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prune2Q52KR3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prune2Q52KR3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prune2Q52KR3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prune2Q52KR3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prune2Q52KR3 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prune2Q52KR3 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prune2Q52KR3 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prune2Q52KR3 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prune2Q52KR3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prune2Q52KR3 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prune2Q52KR3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prune2Q52KR3 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prune2Q52KR3 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prune2Q52KR3 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prune2Q52KR3 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prune2Q52KR3 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prune2Q52KR3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prune2Q52KR3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prune2Q52KR3 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prune2Q52KR3 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prune2Q52KR3 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prune2Q52KR3 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prune2Q52KR3 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prune2Q52KR3 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prune2Q52KR3 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prune2Q52KR3 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prune2Q52KR3 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prune2Q52KR3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Prune2Q52KR3 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prune2Q52KR3 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prune2Q52KR3 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prune2Q52KR3 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prune2Q52KR3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prune2Q52KR3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prune2Q52KR3 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prune2Q52KR3 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prune2Q52KR3 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prune2Q52KR3 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prune2Q52KR3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prune2Q52KR3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prune2Q52KR3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prune2Q52KR3 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prune2Q52KR3 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prune2Q52KR3 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prune2Q52KR3 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prune2Q52KR3 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Prune2Q52KR3 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prune2Q52KR3 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prune2Q52KR3 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Prune2Q52KR3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Prune2Q52KR3 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Prune2Q52KR3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Prune2Q52KR3 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prune2Q52KR3 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Prune2Q52KR3 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prune2Q52KR3 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prune2Q52KR3 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prune2Q52KR3 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Prune2Q52KR3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Prune2Q52KR3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prune2Q52KR3 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prune2Q52KR3 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Prune2Q52KR3 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prune2Q52KR3 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prune2Q52KR3 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prune2Q52KR3 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prune2Q52KR3 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prune2Q52KR3 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prune2Q52KR3 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prune2Q52KR3 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prune2Q52KR3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prune2Q52KR3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prune2Q52KR3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prune2Q52KR3 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prune2Q52KR3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prune2Q52KR3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prune2Q52KR3 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prune2Q52KR3 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prune2Q52KR3 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prune2Q52KR3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prune2Q52KR3 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prune2Q52KR3 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prune2Q52KR3 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prune2Q52KR3 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prune2Q52KR3 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prune2Q52KR3 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prune2Q52KR3 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prune2Q52KR3 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prune2Q52KR3 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Prune2Q52KR3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prune2Q52KR3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prune2Q52KR3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prune2Q52KR3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms