Protein–RNA interactions for Protein: Q505D7

Opa3, Optic atrophy 3 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opa3Q505D7 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Opa3Q505D7 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Opa3Q505D7 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Opa3Q505D7 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Opa3Q505D7 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Opa3Q505D7 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Opa3Q505D7 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Opa3Q505D7 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Opa3Q505D7 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Opa3Q505D7 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Opa3Q505D7 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Opa3Q505D7 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Opa3Q505D7 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Opa3Q505D7 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Opa3Q505D7 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Opa3Q505D7 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Opa3Q505D7 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Opa3Q505D7 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Opa3Q505D7 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Opa3Q505D7 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Opa3Q505D7 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Opa3Q505D7 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Opa3Q505D7 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Opa3Q505D7 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Opa3Q505D7 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Opa3Q505D7 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Opa3Q505D7 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Opa3Q505D7 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Opa3Q505D7 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Opa3Q505D7 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Opa3Q505D7 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Opa3Q505D7 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Opa3Q505D7 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Opa3Q505D7 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Opa3Q505D7 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Opa3Q505D7 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Opa3Q505D7 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Opa3Q505D7 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Opa3Q505D7 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Opa3Q505D7 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Opa3Q505D7 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Opa3Q505D7 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Opa3Q505D7 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Opa3Q505D7 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Opa3Q505D7 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Opa3Q505D7 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Opa3Q505D7 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Opa3Q505D7 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Opa3Q505D7 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Opa3Q505D7 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Opa3Q505D7 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Opa3Q505D7 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Opa3Q505D7 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Opa3Q505D7 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Opa3Q505D7 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Opa3Q505D7 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Opa3Q505D7 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Opa3Q505D7 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Opa3Q505D7 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Opa3Q505D7 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Opa3Q505D7 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Opa3Q505D7 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Opa3Q505D7 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Opa3Q505D7 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Opa3Q505D7 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Opa3Q505D7 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Opa3Q505D7 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Opa3Q505D7 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Opa3Q505D7 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Opa3Q505D7 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Opa3Q505D7 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Opa3Q505D7 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Opa3Q505D7 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Opa3Q505D7 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Opa3Q505D7 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Opa3Q505D7 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Opa3Q505D7 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Opa3Q505D7 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Opa3Q505D7 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Opa3Q505D7 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Opa3Q505D7 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Opa3Q505D7 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Opa3Q505D7 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Opa3Q505D7 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Opa3Q505D7 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Opa3Q505D7 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Opa3Q505D7 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Opa3Q505D7 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Opa3Q505D7 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Opa3Q505D7 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Opa3Q505D7 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Opa3Q505D7 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Opa3Q505D7 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Opa3Q505D7 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Opa3Q505D7 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Opa3Q505D7 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Opa3Q505D7 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Opa3Q505D7 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Opa3Q505D7 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Opa3Q505D7 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms