Protein–RNA interactions for Protein: Q4VA36

Ccdc84, Coiled-coil domain-containing protein 84, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc84Q4VA36 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc84Q4VA36 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc84Q4VA36 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc84Q4VA36 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc84Q4VA36 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc84Q4VA36 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc84Q4VA36 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc84Q4VA36 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc84Q4VA36 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc84Q4VA36 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc84Q4VA36 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc84Q4VA36 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc84Q4VA36 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc84Q4VA36 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc84Q4VA36 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc84Q4VA36 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc84Q4VA36 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc84Q4VA36 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc84Q4VA36 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc84Q4VA36 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc84Q4VA36 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc84Q4VA36 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc84Q4VA36 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc84Q4VA36 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc84Q4VA36 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc84Q4VA36 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc84Q4VA36 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc84Q4VA36 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc84Q4VA36 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc84Q4VA36 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccdc84Q4VA36 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccdc84Q4VA36 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccdc84Q4VA36 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccdc84Q4VA36 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccdc84Q4VA36 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc84Q4VA36 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc84Q4VA36 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc84Q4VA36 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc84Q4VA36 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc84Q4VA36 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc84Q4VA36 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc84Q4VA36 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc84Q4VA36 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc84Q4VA36 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc84Q4VA36 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc84Q4VA36 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc84Q4VA36 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc84Q4VA36 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc84Q4VA36 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc84Q4VA36 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc84Q4VA36 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc84Q4VA36 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc84Q4VA36 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc84Q4VA36 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc84Q4VA36 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc84Q4VA36 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc84Q4VA36 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc84Q4VA36 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc84Q4VA36 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc84Q4VA36 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc84Q4VA36 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc84Q4VA36 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc84Q4VA36 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc84Q4VA36 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc84Q4VA36 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc84Q4VA36 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc84Q4VA36 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc84Q4VA36 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc84Q4VA36 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc84Q4VA36 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc84Q4VA36 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc84Q4VA36 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc84Q4VA36 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc84Q4VA36 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc84Q4VA36 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc84Q4VA36 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc84Q4VA36 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc84Q4VA36 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc84Q4VA36 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc84Q4VA36 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc84Q4VA36 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc84Q4VA36 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc84Q4VA36 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc84Q4VA36 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc84Q4VA36 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc84Q4VA36 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc84Q4VA36 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc84Q4VA36 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc84Q4VA36 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc84Q4VA36 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc84Q4VA36 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc84Q4VA36 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc84Q4VA36 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc84Q4VA36 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc84Q4VA36 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc84Q4VA36 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc84Q4VA36 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc84Q4VA36 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc84Q4VA36 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc84Q4VA36 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms