Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Shank3Q4ACU6 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Shank3Q4ACU6 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Shank3Q4ACU6 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Shank3Q4ACU6 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Shank3Q4ACU6 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Shank3Q4ACU6 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Shank3Q4ACU6 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Shank3Q4ACU6 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Shank3Q4ACU6 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Shank3Q4ACU6 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Shank3Q4ACU6 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Shank3Q4ACU6 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Shank3Q4ACU6 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Shank3Q4ACU6 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Shank3Q4ACU6 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Shank3Q4ACU6 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Shank3Q4ACU6 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Shank3Q4ACU6 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Shank3Q4ACU6 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Shank3Q4ACU6 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Shank3Q4ACU6 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Shank3Q4ACU6 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Shank3Q4ACU6 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Shank3Q4ACU6 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Shank3Q4ACU6 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Shank3Q4ACU6 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Shank3Q4ACU6 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Shank3Q4ACU6 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Shank3Q4ACU6 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Shank3Q4ACU6 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Shank3Q4ACU6 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Shank3Q4ACU6 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Shank3Q4ACU6 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Shank3Q4ACU6 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Shank3Q4ACU6 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Shank3Q4ACU6 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Shank3Q4ACU6 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Shank3Q4ACU6 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Shank3Q4ACU6 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Shank3Q4ACU6 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Shank3Q4ACU6 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Shank3Q4ACU6 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Shank3Q4ACU6 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Shank3Q4ACU6 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Shank3Q4ACU6 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Shank3Q4ACU6 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Shank3Q4ACU6 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Shank3Q4ACU6 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Shank3Q4ACU6 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Shank3Q4ACU6 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Shank3Q4ACU6 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Shank3Q4ACU6 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Shank3Q4ACU6 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Shank3Q4ACU6 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Shank3Q4ACU6 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Shank3Q4ACU6 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Shank3Q4ACU6 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Shank3Q4ACU6 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Shank3Q4ACU6 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Shank3Q4ACU6 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Shank3Q4ACU6 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Shank3Q4ACU6 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Shank3Q4ACU6 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Shank3Q4ACU6 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Shank3Q4ACU6 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Shank3Q4ACU6 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Shank3Q4ACU6 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Shank3Q4ACU6 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Shank3Q4ACU6 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Shank3Q4ACU6 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Shank3Q4ACU6 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Shank3Q4ACU6 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Shank3Q4ACU6 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Shank3Q4ACU6 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Shank3Q4ACU6 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Shank3Q4ACU6 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Shank3Q4ACU6 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Shank3Q4ACU6 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Shank3Q4ACU6 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Shank3Q4ACU6 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Shank3Q4ACU6 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Shank3Q4ACU6 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Shank3Q4ACU6 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Shank3Q4ACU6 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Shank3Q4ACU6 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Shank3Q4ACU6 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Shank3Q4ACU6 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Shank3Q4ACU6 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Shank3Q4ACU6 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Shank3Q4ACU6 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Shank3Q4ACU6 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Shank3Q4ACU6 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Shank3Q4ACU6 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Shank3Q4ACU6 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Shank3Q4ACU6 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Shank3Q4ACU6 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Shank3Q4ACU6 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Shank3Q4ACU6 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Shank3Q4ACU6 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms