Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZN08

Fam220a, Protein FAM220A, mousemouse

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Length 260 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam220aQ3ZN08 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam220aQ3ZN08 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam220aQ3ZN08 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam220aQ3ZN08 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Fam220aQ3ZN08 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam220aQ3ZN08 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam220aQ3ZN08 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam220aQ3ZN08 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam220aQ3ZN08 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam220aQ3ZN08 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam220aQ3ZN08 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam220aQ3ZN08 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam220aQ3ZN08 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam220aQ3ZN08 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam220aQ3ZN08 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam220aQ3ZN08 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam220aQ3ZN08 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam220aQ3ZN08 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam220aQ3ZN08 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam220aQ3ZN08 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam220aQ3ZN08 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam220aQ3ZN08 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam220aQ3ZN08 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam220aQ3ZN08 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam220aQ3ZN08 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam220aQ3ZN08 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam220aQ3ZN08 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam220aQ3ZN08 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam220aQ3ZN08 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam220aQ3ZN08 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam220aQ3ZN08 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam220aQ3ZN08 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam220aQ3ZN08 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam220aQ3ZN08 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam220aQ3ZN08 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam220aQ3ZN08 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam220aQ3ZN08 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam220aQ3ZN08 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam220aQ3ZN08 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam220aQ3ZN08 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam220aQ3ZN08 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam220aQ3ZN08 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam220aQ3ZN08 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam220aQ3ZN08 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam220aQ3ZN08 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam220aQ3ZN08 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam220aQ3ZN08 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam220aQ3ZN08 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam220aQ3ZN08 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam220aQ3ZN08 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam220aQ3ZN08 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam220aQ3ZN08 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam220aQ3ZN08 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Fam220aQ3ZN08 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Fam220aQ3ZN08 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam220aQ3ZN08 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam220aQ3ZN08 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam220aQ3ZN08 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Fam220aQ3ZN08 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam220aQ3ZN08 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam220aQ3ZN08 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Fam220aQ3ZN08 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam220aQ3ZN08 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam220aQ3ZN08 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam220aQ3ZN08 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam220aQ3ZN08 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Fam220aQ3ZN08 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Fam220aQ3ZN08 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam220aQ3ZN08 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam220aQ3ZN08 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam220aQ3ZN08 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam220aQ3ZN08 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam220aQ3ZN08 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam220aQ3ZN08 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam220aQ3ZN08 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam220aQ3ZN08 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam220aQ3ZN08 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam220aQ3ZN08 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam220aQ3ZN08 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam220aQ3ZN08 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
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Fam220aQ3ZN08 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Fam220aQ3ZN08 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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