Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3V9

Carmil2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil2Q3V3V9 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Carmil2Q3V3V9 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Carmil2Q3V3V9 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Carmil2Q3V3V9 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Carmil2Q3V3V9 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Carmil2Q3V3V9 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Carmil2Q3V3V9 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Carmil2Q3V3V9 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Carmil2Q3V3V9 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Carmil2Q3V3V9 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Carmil2Q3V3V9 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Carmil2Q3V3V9 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Carmil2Q3V3V9 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Carmil2Q3V3V9 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Carmil2Q3V3V9 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Carmil2Q3V3V9 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Carmil2Q3V3V9 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Carmil2Q3V3V9 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Carmil2Q3V3V9 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Carmil2Q3V3V9 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Carmil2Q3V3V9 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Carmil2Q3V3V9 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Carmil2Q3V3V9 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Carmil2Q3V3V9 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Carmil2Q3V3V9 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Carmil2Q3V3V9 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Carmil2Q3V3V9 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Carmil2Q3V3V9 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Carmil2Q3V3V9 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Carmil2Q3V3V9 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Carmil2Q3V3V9 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Carmil2Q3V3V9 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Carmil2Q3V3V9 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Carmil2Q3V3V9 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Carmil2Q3V3V9 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Carmil2Q3V3V9 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Carmil2Q3V3V9 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Carmil2Q3V3V9 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Carmil2Q3V3V9 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Carmil2Q3V3V9 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Carmil2Q3V3V9 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Carmil2Q3V3V9 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Carmil2Q3V3V9 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Carmil2Q3V3V9 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Carmil2Q3V3V9 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Carmil2Q3V3V9 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Carmil2Q3V3V9 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Carmil2Q3V3V9 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Carmil2Q3V3V9 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Carmil2Q3V3V9 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Carmil2Q3V3V9 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Carmil2Q3V3V9 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Carmil2Q3V3V9 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Carmil2Q3V3V9 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Carmil2Q3V3V9 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Carmil2Q3V3V9 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Carmil2Q3V3V9 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Carmil2Q3V3V9 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Carmil2Q3V3V9 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Carmil2Q3V3V9 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Carmil2Q3V3V9 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Carmil2Q3V3V9 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Carmil2Q3V3V9 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Carmil2Q3V3V9 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Carmil2Q3V3V9 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Carmil2Q3V3V9 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Carmil2Q3V3V9 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Carmil2Q3V3V9 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Carmil2Q3V3V9 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Carmil2Q3V3V9 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Carmil2Q3V3V9 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Carmil2Q3V3V9 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Carmil2Q3V3V9 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Carmil2Q3V3V9 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Carmil2Q3V3V9 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Carmil2Q3V3V9 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Carmil2Q3V3V9 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Carmil2Q3V3V9 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Carmil2Q3V3V9 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Carmil2Q3V3V9 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Carmil2Q3V3V9 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Carmil2Q3V3V9 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Carmil2Q3V3V9 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Carmil2Q3V3V9 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Carmil2Q3V3V9 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Carmil2Q3V3V9 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Carmil2Q3V3V9 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Carmil2Q3V3V9 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Carmil2Q3V3V9 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Carmil2Q3V3V9 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Carmil2Q3V3V9 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Carmil2Q3V3V9 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Carmil2Q3V3V9 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Carmil2Q3V3V9 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Carmil2Q3V3V9 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Carmil2Q3V3V9 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Carmil2Q3V3V9 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Carmil2Q3V3V9 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Carmil2Q3V3V9 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Carmil2Q3V3V9 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms