Protein–RNA interactions for Protein: Q3V2W7

4930518I15Rik, RIKEN cDNA 4930518I15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930518I15RikQ3V2W7 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930518I15RikQ3V2W7 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930518I15RikQ3V2W7 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
4930518I15RikQ3V2W7 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930518I15RikQ3V2W7 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930518I15RikQ3V2W7 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930518I15RikQ3V2W7 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930518I15RikQ3V2W7 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930518I15RikQ3V2W7 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930518I15RikQ3V2W7 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930518I15RikQ3V2W7 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930518I15RikQ3V2W7 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930518I15RikQ3V2W7 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930518I15RikQ3V2W7 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930518I15RikQ3V2W7 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930518I15RikQ3V2W7 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930518I15RikQ3V2W7 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930518I15RikQ3V2W7 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930518I15RikQ3V2W7 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930518I15RikQ3V2W7 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930518I15RikQ3V2W7 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930518I15RikQ3V2W7 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930518I15RikQ3V2W7 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930518I15RikQ3V2W7 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930518I15RikQ3V2W7 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930518I15RikQ3V2W7 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930518I15RikQ3V2W7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930518I15RikQ3V2W7 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930518I15RikQ3V2W7 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930518I15RikQ3V2W7 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930518I15RikQ3V2W7 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930518I15RikQ3V2W7 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930518I15RikQ3V2W7 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930518I15RikQ3V2W7 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930518I15RikQ3V2W7 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930518I15RikQ3V2W7 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930518I15RikQ3V2W7 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930518I15RikQ3V2W7 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930518I15RikQ3V2W7 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930518I15RikQ3V2W7 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930518I15RikQ3V2W7 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930518I15RikQ3V2W7 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930518I15RikQ3V2W7 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930518I15RikQ3V2W7 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930518I15RikQ3V2W7 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930518I15RikQ3V2W7 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930518I15RikQ3V2W7 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930518I15RikQ3V2W7 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930518I15RikQ3V2W7 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930518I15RikQ3V2W7 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930518I15RikQ3V2W7 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930518I15RikQ3V2W7 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930518I15RikQ3V2W7 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930518I15RikQ3V2W7 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930518I15RikQ3V2W7 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930518I15RikQ3V2W7 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
4930518I15RikQ3V2W7 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
4930518I15RikQ3V2W7 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
4930518I15RikQ3V2W7 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
4930518I15RikQ3V2W7 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
4930518I15RikQ3V2W7 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
4930518I15RikQ3V2W7 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
4930518I15RikQ3V2W7 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
4930518I15RikQ3V2W7 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
4930518I15RikQ3V2W7 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
4930518I15RikQ3V2W7 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
4930518I15RikQ3V2W7 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
4930518I15RikQ3V2W7 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
4930518I15RikQ3V2W7 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
4930518I15RikQ3V2W7 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
4930518I15RikQ3V2W7 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
4930518I15RikQ3V2W7 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
4930518I15RikQ3V2W7 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
4930518I15RikQ3V2W7 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
4930518I15RikQ3V2W7 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
4930518I15RikQ3V2W7 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
4930518I15RikQ3V2W7 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
4930518I15RikQ3V2W7 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
4930518I15RikQ3V2W7 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
4930518I15RikQ3V2W7 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
4930518I15RikQ3V2W7 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
4930518I15RikQ3V2W7 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
4930518I15RikQ3V2W7 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
4930518I15RikQ3V2W7 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
4930518I15RikQ3V2W7 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
4930518I15RikQ3V2W7 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
4930518I15RikQ3V2W7 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
4930518I15RikQ3V2W7 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
4930518I15RikQ3V2W7 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
4930518I15RikQ3V2W7 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
4930518I15RikQ3V2W7 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
4930518I15RikQ3V2W7 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
4930518I15RikQ3V2W7 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
4930518I15RikQ3V2W7 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
4930518I15RikQ3V2W7 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
4930518I15RikQ3V2W7 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
4930518I15RikQ3V2W7 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
4930518I15RikQ3V2W7 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
4930518I15RikQ3V2W7 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
4930518I15RikQ3V2W7 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms