Protein–RNA interactions for Protein: Q3V209

Tmub2, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmub2Q3V209 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmub2Q3V209 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmub2Q3V209 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmub2Q3V209 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmub2Q3V209 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmub2Q3V209 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmub2Q3V209 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmub2Q3V209 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmub2Q3V209 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmub2Q3V209 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmub2Q3V209 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmub2Q3V209 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmub2Q3V209 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmub2Q3V209 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmub2Q3V209 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmub2Q3V209 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmub2Q3V209 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmub2Q3V209 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmub2Q3V209 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmub2Q3V209 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmub2Q3V209 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmub2Q3V209 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmub2Q3V209 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmub2Q3V209 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmub2Q3V209 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmub2Q3V209 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmub2Q3V209 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmub2Q3V209 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmub2Q3V209 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmub2Q3V209 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmub2Q3V209 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmub2Q3V209 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmub2Q3V209 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmub2Q3V209 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmub2Q3V209 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmub2Q3V209 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmub2Q3V209 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmub2Q3V209 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmub2Q3V209 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmub2Q3V209 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmub2Q3V209 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmub2Q3V209 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmub2Q3V209 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmub2Q3V209 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmub2Q3V209 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmub2Q3V209 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmub2Q3V209 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmub2Q3V209 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmub2Q3V209 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmub2Q3V209 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmub2Q3V209 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmub2Q3V209 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmub2Q3V209 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmub2Q3V209 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmub2Q3V209 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmub2Q3V209 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmub2Q3V209 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmub2Q3V209 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmub2Q3V209 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmub2Q3V209 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmub2Q3V209 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmub2Q3V209 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmub2Q3V209 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmub2Q3V209 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmub2Q3V209 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Tmub2Q3V209 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmub2Q3V209 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmub2Q3V209 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmub2Q3V209 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmub2Q3V209 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmub2Q3V209 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmub2Q3V209 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmub2Q3V209 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmub2Q3V209 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmub2Q3V209 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmub2Q3V209 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmub2Q3V209 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmub2Q3V209 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmub2Q3V209 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmub2Q3V209 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmub2Q3V209 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmub2Q3V209 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmub2Q3V209 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmub2Q3V209 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmub2Q3V209 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmub2Q3V209 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmub2Q3V209 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmub2Q3V209 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmub2Q3V209 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmub2Q3V209 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmub2Q3V209 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmub2Q3V209 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmub2Q3V209 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmub2Q3V209 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmub2Q3V209 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmub2Q3V209 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmub2Q3V209 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmub2Q3V209 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmub2Q3V209 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmub2Q3V209 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms