Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1H1

Ckap2, Cytoskeleton-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2Q3V1H1 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ckap2Q3V1H1 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ckap2Q3V1H1 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ckap2Q3V1H1 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ckap2Q3V1H1 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ckap2Q3V1H1 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ckap2Q3V1H1 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ckap2Q3V1H1 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ckap2Q3V1H1 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ckap2Q3V1H1 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ckap2Q3V1H1 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ckap2Q3V1H1 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ckap2Q3V1H1 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ckap2Q3V1H1 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ckap2Q3V1H1 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ckap2Q3V1H1 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ckap2Q3V1H1 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ckap2Q3V1H1 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ckap2Q3V1H1 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ckap2Q3V1H1 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ckap2Q3V1H1 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ckap2Q3V1H1 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ckap2Q3V1H1 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ckap2Q3V1H1 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ckap2Q3V1H1 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ckap2Q3V1H1 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ckap2Q3V1H1 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ckap2Q3V1H1 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ckap2Q3V1H1 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ckap2Q3V1H1 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ckap2Q3V1H1 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ckap2Q3V1H1 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ckap2Q3V1H1 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ckap2Q3V1H1 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ckap2Q3V1H1 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ckap2Q3V1H1 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ckap2Q3V1H1 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ckap2Q3V1H1 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ckap2Q3V1H1 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ckap2Q3V1H1 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ckap2Q3V1H1 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ckap2Q3V1H1 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ckap2Q3V1H1 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Ckap2Q3V1H1 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ckap2Q3V1H1 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ckap2Q3V1H1 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ckap2Q3V1H1 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ckap2Q3V1H1 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ckap2Q3V1H1 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ckap2Q3V1H1 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ckap2Q3V1H1 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ckap2Q3V1H1 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ckap2Q3V1H1 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ckap2Q3V1H1 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ckap2Q3V1H1 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ckap2Q3V1H1 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ckap2Q3V1H1 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ckap2Q3V1H1 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ckap2Q3V1H1 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Ckap2Q3V1H1 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ckap2Q3V1H1 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ckap2Q3V1H1 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ckap2Q3V1H1 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ckap2Q3V1H1 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ckap2Q3V1H1 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ckap2Q3V1H1 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ckap2Q3V1H1 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ckap2Q3V1H1 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ckap2Q3V1H1 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Ckap2Q3V1H1 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ckap2Q3V1H1 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ckap2Q3V1H1 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ckap2Q3V1H1 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ckap2Q3V1H1 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ckap2Q3V1H1 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ckap2Q3V1H1 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ckap2Q3V1H1 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ckap2Q3V1H1 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ckap2Q3V1H1 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ckap2Q3V1H1 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ckap2Q3V1H1 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ckap2Q3V1H1 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ckap2Q3V1H1 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ckap2Q3V1H1 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ckap2Q3V1H1 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ckap2Q3V1H1 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ckap2Q3V1H1 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ckap2Q3V1H1 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ckap2Q3V1H1 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ckap2Q3V1H1 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ckap2Q3V1H1 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ckap2Q3V1H1 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ckap2Q3V1H1 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ckap2Q3V1H1 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ckap2Q3V1H1 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ckap2Q3V1H1 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ckap2Q3V1H1 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ckap2Q3V1H1 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ckap2Q3V1H1 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ckap2Q3V1H1 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms