Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0K5

4930567H17Rik, RIKEN cDNA 4930567H17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930567H17RikQ3V0K5 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
4930567H17RikQ3V0K5 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
4930567H17RikQ3V0K5 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
4930567H17RikQ3V0K5 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
4930567H17RikQ3V0K5 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
4930567H17RikQ3V0K5 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
4930567H17RikQ3V0K5 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
4930567H17RikQ3V0K5 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
4930567H17RikQ3V0K5 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
4930567H17RikQ3V0K5 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
4930567H17RikQ3V0K5 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
4930567H17RikQ3V0K5 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
4930567H17RikQ3V0K5 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
4930567H17RikQ3V0K5 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
4930567H17RikQ3V0K5 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
4930567H17RikQ3V0K5 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
4930567H17RikQ3V0K5 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
4930567H17RikQ3V0K5 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
4930567H17RikQ3V0K5 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
4930567H17RikQ3V0K5 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
4930567H17RikQ3V0K5 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
4930567H17RikQ3V0K5 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
4930567H17RikQ3V0K5 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
4930567H17RikQ3V0K5 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
4930567H17RikQ3V0K5 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
4930567H17RikQ3V0K5 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
4930567H17RikQ3V0K5 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
4930567H17RikQ3V0K5 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
4930567H17RikQ3V0K5 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
4930567H17RikQ3V0K5 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
4930567H17RikQ3V0K5 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
4930567H17RikQ3V0K5 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
4930567H17RikQ3V0K5 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
4930567H17RikQ3V0K5 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
4930567H17RikQ3V0K5 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC23.27■■□□□ 1.31
4930567H17RikQ3V0K5 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
4930567H17RikQ3V0K5 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
4930567H17RikQ3V0K5 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
4930567H17RikQ3V0K5 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
4930567H17RikQ3V0K5 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
4930567H17RikQ3V0K5 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
4930567H17RikQ3V0K5 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
4930567H17RikQ3V0K5 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
4930567H17RikQ3V0K5 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
4930567H17RikQ3V0K5 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
4930567H17RikQ3V0K5 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
4930567H17RikQ3V0K5 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
4930567H17RikQ3V0K5 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
4930567H17RikQ3V0K5 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
4930567H17RikQ3V0K5 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
4930567H17RikQ3V0K5 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
4930567H17RikQ3V0K5 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
4930567H17RikQ3V0K5 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
4930567H17RikQ3V0K5 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
4930567H17RikQ3V0K5 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
4930567H17RikQ3V0K5 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
4930567H17RikQ3V0K5 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
4930567H17RikQ3V0K5 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
4930567H17RikQ3V0K5 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
4930567H17RikQ3V0K5 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
4930567H17RikQ3V0K5 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
4930567H17RikQ3V0K5 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
4930567H17RikQ3V0K5 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
4930567H17RikQ3V0K5 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
4930567H17RikQ3V0K5 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
4930567H17RikQ3V0K5 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
4930567H17RikQ3V0K5 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
4930567H17RikQ3V0K5 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
4930567H17RikQ3V0K5 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
4930567H17RikQ3V0K5 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
4930567H17RikQ3V0K5 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
4930567H17RikQ3V0K5 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
4930567H17RikQ3V0K5 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
4930567H17RikQ3V0K5 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
4930567H17RikQ3V0K5 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
4930567H17RikQ3V0K5 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
4930567H17RikQ3V0K5 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
4930567H17RikQ3V0K5 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
4930567H17RikQ3V0K5 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
4930567H17RikQ3V0K5 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
4930567H17RikQ3V0K5 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
4930567H17RikQ3V0K5 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
4930567H17RikQ3V0K5 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
4930567H17RikQ3V0K5 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
4930567H17RikQ3V0K5 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
4930567H17RikQ3V0K5 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
4930567H17RikQ3V0K5 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
4930567H17RikQ3V0K5 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
4930567H17RikQ3V0K5 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
4930567H17RikQ3V0K5 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
4930567H17RikQ3V0K5 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
4930567H17RikQ3V0K5 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
4930567H17RikQ3V0K5 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
4930567H17RikQ3V0K5 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
4930567H17RikQ3V0K5 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
4930567H17RikQ3V0K5 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
4930567H17RikQ3V0K5 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
4930567H17RikQ3V0K5 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
4930567H17RikQ3V0K5 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
4930567H17RikQ3V0K5 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms