Protein–RNA interactions for Protein: Q3V036

Ccdc27, Coiled-coil domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc27Q3V036 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc27Q3V036 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc27Q3V036 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc27Q3V036 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc27Q3V036 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc27Q3V036 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc27Q3V036 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc27Q3V036 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc27Q3V036 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc27Q3V036 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc27Q3V036 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc27Q3V036 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc27Q3V036 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc27Q3V036 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc27Q3V036 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc27Q3V036 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc27Q3V036 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc27Q3V036 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc27Q3V036 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc27Q3V036 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc27Q3V036 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc27Q3V036 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc27Q3V036 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc27Q3V036 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc27Q3V036 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc27Q3V036 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc27Q3V036 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc27Q3V036 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc27Q3V036 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc27Q3V036 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc27Q3V036 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc27Q3V036 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc27Q3V036 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc27Q3V036 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc27Q3V036 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc27Q3V036 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc27Q3V036 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc27Q3V036 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc27Q3V036 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc27Q3V036 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc27Q3V036 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc27Q3V036 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc27Q3V036 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc27Q3V036 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc27Q3V036 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc27Q3V036 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc27Q3V036 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc27Q3V036 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc27Q3V036 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc27Q3V036 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc27Q3V036 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc27Q3V036 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc27Q3V036 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc27Q3V036 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc27Q3V036 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc27Q3V036 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc27Q3V036 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc27Q3V036 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc27Q3V036 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc27Q3V036 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc27Q3V036 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc27Q3V036 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc27Q3V036 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc27Q3V036 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc27Q3V036 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc27Q3V036 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc27Q3V036 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc27Q3V036 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc27Q3V036 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc27Q3V036 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc27Q3V036 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc27Q3V036 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc27Q3V036 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc27Q3V036 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc27Q3V036 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc27Q3V036 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc27Q3V036 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc27Q3V036 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc27Q3V036 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc27Q3V036 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc27Q3V036 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc27Q3V036 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc27Q3V036 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc27Q3V036 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc27Q3V036 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc27Q3V036 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc27Q3V036 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc27Q3V036 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc27Q3V036 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc27Q3V036 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc27Q3V036 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc27Q3V036 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc27Q3V036 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc27Q3V036 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc27Q3V036 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc27Q3V036 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc27Q3V036 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc27Q3V036 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc27Q3V036 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc27Q3V036 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms