Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW68

Capn13, Calpain-13, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn13Q3UW68 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Capn13Q3UW68 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Capn13Q3UW68 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Capn13Q3UW68 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Capn13Q3UW68 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Capn13Q3UW68 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Capn13Q3UW68 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Capn13Q3UW68 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Capn13Q3UW68 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Capn13Q3UW68 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Capn13Q3UW68 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Capn13Q3UW68 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Capn13Q3UW68 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Capn13Q3UW68 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Capn13Q3UW68 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Capn13Q3UW68 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Capn13Q3UW68 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Capn13Q3UW68 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Capn13Q3UW68 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Capn13Q3UW68 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Capn13Q3UW68 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Capn13Q3UW68 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Capn13Q3UW68 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Capn13Q3UW68 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Capn13Q3UW68 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Capn13Q3UW68 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Capn13Q3UW68 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Capn13Q3UW68 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Capn13Q3UW68 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Capn13Q3UW68 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Capn13Q3UW68 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Capn13Q3UW68 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Capn13Q3UW68 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Capn13Q3UW68 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Capn13Q3UW68 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Capn13Q3UW68 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Capn13Q3UW68 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Capn13Q3UW68 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Capn13Q3UW68 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Capn13Q3UW68 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Capn13Q3UW68 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Capn13Q3UW68 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Capn13Q3UW68 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Capn13Q3UW68 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Capn13Q3UW68 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Capn13Q3UW68 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Capn13Q3UW68 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Capn13Q3UW68 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Capn13Q3UW68 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Capn13Q3UW68 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Capn13Q3UW68 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Capn13Q3UW68 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Capn13Q3UW68 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Capn13Q3UW68 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Capn13Q3UW68 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Capn13Q3UW68 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Capn13Q3UW68 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Capn13Q3UW68 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Capn13Q3UW68 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Capn13Q3UW68 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Capn13Q3UW68 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Capn13Q3UW68 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Capn13Q3UW68 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Capn13Q3UW68 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Capn13Q3UW68 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Capn13Q3UW68 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Capn13Q3UW68 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Capn13Q3UW68 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Capn13Q3UW68 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Capn13Q3UW68 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Capn13Q3UW68 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Capn13Q3UW68 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Capn13Q3UW68 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Capn13Q3UW68 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Capn13Q3UW68 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Capn13Q3UW68 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Capn13Q3UW68 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Capn13Q3UW68 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Capn13Q3UW68 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Capn13Q3UW68 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Capn13Q3UW68 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Capn13Q3UW68 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Capn13Q3UW68 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Capn13Q3UW68 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Capn13Q3UW68 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Capn13Q3UW68 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Capn13Q3UW68 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Capn13Q3UW68 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Capn13Q3UW68 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Capn13Q3UW68 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Capn13Q3UW68 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Capn13Q3UW68 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Capn13Q3UW68 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Capn13Q3UW68 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Capn13Q3UW68 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Capn13Q3UW68 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Capn13Q3UW68 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Capn13Q3UW68 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Capn13Q3UW68 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Capn13Q3UW68 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms