Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV70

Pdp1, [Pyruvate dehydrogenase [acetyl-transferring]]-phosphatase 1, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdp1Q3UV70 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdp1Q3UV70 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdp1Q3UV70 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdp1Q3UV70 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdp1Q3UV70 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdp1Q3UV70 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdp1Q3UV70 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdp1Q3UV70 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdp1Q3UV70 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdp1Q3UV70 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdp1Q3UV70 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdp1Q3UV70 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdp1Q3UV70 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdp1Q3UV70 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdp1Q3UV70 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdp1Q3UV70 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdp1Q3UV70 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdp1Q3UV70 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdp1Q3UV70 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdp1Q3UV70 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdp1Q3UV70 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdp1Q3UV70 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdp1Q3UV70 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdp1Q3UV70 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdp1Q3UV70 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdp1Q3UV70 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdp1Q3UV70 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdp1Q3UV70 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdp1Q3UV70 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdp1Q3UV70 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdp1Q3UV70 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdp1Q3UV70 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdp1Q3UV70 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdp1Q3UV70 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdp1Q3UV70 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdp1Q3UV70 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdp1Q3UV70 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdp1Q3UV70 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdp1Q3UV70 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdp1Q3UV70 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdp1Q3UV70 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdp1Q3UV70 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdp1Q3UV70 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdp1Q3UV70 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdp1Q3UV70 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdp1Q3UV70 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdp1Q3UV70 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdp1Q3UV70 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdp1Q3UV70 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdp1Q3UV70 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdp1Q3UV70 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdp1Q3UV70 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdp1Q3UV70 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdp1Q3UV70 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdp1Q3UV70 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdp1Q3UV70 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdp1Q3UV70 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdp1Q3UV70 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdp1Q3UV70 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdp1Q3UV70 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdp1Q3UV70 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdp1Q3UV70 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdp1Q3UV70 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdp1Q3UV70 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdp1Q3UV70 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdp1Q3UV70 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdp1Q3UV70 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdp1Q3UV70 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdp1Q3UV70 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdp1Q3UV70 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdp1Q3UV70 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdp1Q3UV70 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdp1Q3UV70 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdp1Q3UV70 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdp1Q3UV70 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdp1Q3UV70 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdp1Q3UV70 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdp1Q3UV70 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdp1Q3UV70 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdp1Q3UV70 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdp1Q3UV70 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdp1Q3UV70 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdp1Q3UV70 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdp1Q3UV70 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdp1Q3UV70 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdp1Q3UV70 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdp1Q3UV70 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdp1Q3UV70 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdp1Q3UV70 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdp1Q3UV70 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdp1Q3UV70 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdp1Q3UV70 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdp1Q3UV70 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pdp1Q3UV70 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pdp1Q3UV70 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pdp1Q3UV70 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdp1Q3UV70 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdp1Q3UV70 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdp1Q3UV70 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdp1Q3UV70 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms