Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU96

Cdc42bpa, Serine/threonine-protein kinase MRCK alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42bpaQ3UU96 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Cdc42bpaQ3UU96 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Cdc42bpaQ3UU96 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Cdc42bpaQ3UU96 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Cdc42bpaQ3UU96 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Cdc42bpaQ3UU96 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Cdc42bpaQ3UU96 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Cdc42bpaQ3UU96 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Cdc42bpaQ3UU96 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Cdc42bpaQ3UU96 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Cdc42bpaQ3UU96 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cdc42bpaQ3UU96 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cdc42bpaQ3UU96 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cdc42bpaQ3UU96 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cdc42bpaQ3UU96 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cdc42bpaQ3UU96 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cdc42bpaQ3UU96 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cdc42bpaQ3UU96 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cdc42bpaQ3UU96 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cdc42bpaQ3UU96 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cdc42bpaQ3UU96 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cdc42bpaQ3UU96 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cdc42bpaQ3UU96 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cdc42bpaQ3UU96 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cdc42bpaQ3UU96 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cdc42bpaQ3UU96 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cdc42bpaQ3UU96 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cdc42bpaQ3UU96 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cdc42bpaQ3UU96 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cdc42bpaQ3UU96 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cdc42bpaQ3UU96 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cdc42bpaQ3UU96 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cdc42bpaQ3UU96 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cdc42bpaQ3UU96 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cdc42bpaQ3UU96 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cdc42bpaQ3UU96 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cdc42bpaQ3UU96 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Cdc42bpaQ3UU96 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cdc42bpaQ3UU96 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cdc42bpaQ3UU96 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cdc42bpaQ3UU96 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cdc42bpaQ3UU96 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cdc42bpaQ3UU96 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cdc42bpaQ3UU96 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cdc42bpaQ3UU96 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cdc42bpaQ3UU96 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cdc42bpaQ3UU96 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cdc42bpaQ3UU96 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cdc42bpaQ3UU96 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cdc42bpaQ3UU96 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cdc42bpaQ3UU96 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cdc42bpaQ3UU96 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cdc42bpaQ3UU96 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cdc42bpaQ3UU96 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cdc42bpaQ3UU96 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cdc42bpaQ3UU96 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cdc42bpaQ3UU96 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cdc42bpaQ3UU96 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cdc42bpaQ3UU96 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cdc42bpaQ3UU96 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cdc42bpaQ3UU96 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cdc42bpaQ3UU96 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cdc42bpaQ3UU96 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cdc42bpaQ3UU96 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cdc42bpaQ3UU96 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cdc42bpaQ3UU96 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cdc42bpaQ3UU96 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Cdc42bpaQ3UU96 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Cdc42bpaQ3UU96 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
Cdc42bpaQ3UU96 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Cdc42bpaQ3UU96 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Cdc42bpaQ3UU96 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Cdc42bpaQ3UU96 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cdc42bpaQ3UU96 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cdc42bpaQ3UU96 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cdc42bpaQ3UU96 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cdc42bpaQ3UU96 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cdc42bpaQ3UU96 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cdc42bpaQ3UU96 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cdc42bpaQ3UU96 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cdc42bpaQ3UU96 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cdc42bpaQ3UU96 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cdc42bpaQ3UU96 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cdc42bpaQ3UU96 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cdc42bpaQ3UU96 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cdc42bpaQ3UU96 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cdc42bpaQ3UU96 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cdc42bpaQ3UU96 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cdc42bpaQ3UU96 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cdc42bpaQ3UU96 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cdc42bpaQ3UU96 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cdc42bpaQ3UU96 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cdc42bpaQ3UU96 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cdc42bpaQ3UU96 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cdc42bpaQ3UU96 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cdc42bpaQ3UU96 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cdc42bpaQ3UU96 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cdc42bpaQ3UU96 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cdc42bpaQ3UU96 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cdc42bpaQ3UU96 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms