Protein–RNA interactions for Protein: Q3USS0

Gm6899, Predicted gene 6899, mousemouse

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6899Q3USS0 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm6899Q3USS0 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm6899Q3USS0 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm6899Q3USS0 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm6899Q3USS0 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm6899Q3USS0 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm6899Q3USS0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm6899Q3USS0 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm6899Q3USS0 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm6899Q3USS0 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm6899Q3USS0 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm6899Q3USS0 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm6899Q3USS0 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm6899Q3USS0 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm6899Q3USS0 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm6899Q3USS0 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm6899Q3USS0 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm6899Q3USS0 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm6899Q3USS0 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm6899Q3USS0 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm6899Q3USS0 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm6899Q3USS0 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm6899Q3USS0 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm6899Q3USS0 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm6899Q3USS0 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm6899Q3USS0 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm6899Q3USS0 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm6899Q3USS0 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm6899Q3USS0 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm6899Q3USS0 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm6899Q3USS0 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm6899Q3USS0 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm6899Q3USS0 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm6899Q3USS0 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm6899Q3USS0 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm6899Q3USS0 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm6899Q3USS0 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm6899Q3USS0 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm6899Q3USS0 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm6899Q3USS0 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm6899Q3USS0 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm6899Q3USS0 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm6899Q3USS0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm6899Q3USS0 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm6899Q3USS0 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm6899Q3USS0 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm6899Q3USS0 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm6899Q3USS0 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm6899Q3USS0 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm6899Q3USS0 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm6899Q3USS0 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm6899Q3USS0 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm6899Q3USS0 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm6899Q3USS0 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm6899Q3USS0 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm6899Q3USS0 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm6899Q3USS0 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm6899Q3USS0 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm6899Q3USS0 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm6899Q3USS0 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm6899Q3USS0 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm6899Q3USS0 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm6899Q3USS0 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm6899Q3USS0 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm6899Q3USS0 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm6899Q3USS0 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm6899Q3USS0 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm6899Q3USS0 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm6899Q3USS0 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm6899Q3USS0 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm6899Q3USS0 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm6899Q3USS0 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm6899Q3USS0 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm6899Q3USS0 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm6899Q3USS0 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm6899Q3USS0 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm6899Q3USS0 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm6899Q3USS0 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm6899Q3USS0 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm6899Q3USS0 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm6899Q3USS0 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm6899Q3USS0 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm6899Q3USS0 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm6899Q3USS0 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm6899Q3USS0 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm6899Q3USS0 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm6899Q3USS0 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm6899Q3USS0 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm6899Q3USS0 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm6899Q3USS0 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm6899Q3USS0 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm6899Q3USS0 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm6899Q3USS0 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm6899Q3USS0 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm6899Q3USS0 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm6899Q3USS0 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm6899Q3USS0 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm6899Q3USS0 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm6899Q3USS0 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm6899Q3USS0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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