Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR0

Shisa3, Protein shisa-3 homolog, mousemouse

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Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa3Q3UPR0 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Shisa3Q3UPR0 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shisa3Q3UPR0 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Shisa3Q3UPR0 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shisa3Q3UPR0 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shisa3Q3UPR0 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shisa3Q3UPR0 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shisa3Q3UPR0 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shisa3Q3UPR0 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shisa3Q3UPR0 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shisa3Q3UPR0 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shisa3Q3UPR0 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shisa3Q3UPR0 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shisa3Q3UPR0 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shisa3Q3UPR0 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shisa3Q3UPR0 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shisa3Q3UPR0 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shisa3Q3UPR0 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Shisa3Q3UPR0 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shisa3Q3UPR0 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shisa3Q3UPR0 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shisa3Q3UPR0 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Shisa3Q3UPR0 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shisa3Q3UPR0 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shisa3Q3UPR0 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shisa3Q3UPR0 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shisa3Q3UPR0 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shisa3Q3UPR0 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shisa3Q3UPR0 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shisa3Q3UPR0 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shisa3Q3UPR0 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shisa3Q3UPR0 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shisa3Q3UPR0 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shisa3Q3UPR0 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shisa3Q3UPR0 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shisa3Q3UPR0 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shisa3Q3UPR0 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shisa3Q3UPR0 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shisa3Q3UPR0 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shisa3Q3UPR0 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shisa3Q3UPR0 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shisa3Q3UPR0 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shisa3Q3UPR0 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shisa3Q3UPR0 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shisa3Q3UPR0 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shisa3Q3UPR0 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shisa3Q3UPR0 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shisa3Q3UPR0 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shisa3Q3UPR0 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shisa3Q3UPR0 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shisa3Q3UPR0 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shisa3Q3UPR0 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shisa3Q3UPR0 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shisa3Q3UPR0 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shisa3Q3UPR0 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shisa3Q3UPR0 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shisa3Q3UPR0 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shisa3Q3UPR0 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shisa3Q3UPR0 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shisa3Q3UPR0 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shisa3Q3UPR0 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shisa3Q3UPR0 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shisa3Q3UPR0 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shisa3Q3UPR0 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shisa3Q3UPR0 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shisa3Q3UPR0 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shisa3Q3UPR0 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shisa3Q3UPR0 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shisa3Q3UPR0 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shisa3Q3UPR0 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shisa3Q3UPR0 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shisa3Q3UPR0 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shisa3Q3UPR0 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Shisa3Q3UPR0 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shisa3Q3UPR0 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shisa3Q3UPR0 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shisa3Q3UPR0 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shisa3Q3UPR0 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shisa3Q3UPR0 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shisa3Q3UPR0 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shisa3Q3UPR0 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shisa3Q3UPR0 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shisa3Q3UPR0 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shisa3Q3UPR0 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shisa3Q3UPR0 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shisa3Q3UPR0 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Shisa3Q3UPR0 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Shisa3Q3UPR0 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shisa3Q3UPR0 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shisa3Q3UPR0 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shisa3Q3UPR0 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shisa3Q3UPR0 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shisa3Q3UPR0 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shisa3Q3UPR0 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shisa3Q3UPR0 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shisa3Q3UPR0 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shisa3Q3UPR0 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shisa3Q3UPR0 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shisa3Q3UPR0 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Shisa3Q3UPR0 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
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