Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPP8

Cep63, Centrosomal protein of 63 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep63Q3UPP8 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cep63Q3UPP8 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cep63Q3UPP8 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cep63Q3UPP8 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cep63Q3UPP8 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cep63Q3UPP8 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cep63Q3UPP8 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cep63Q3UPP8 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cep63Q3UPP8 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cep63Q3UPP8 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cep63Q3UPP8 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cep63Q3UPP8 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cep63Q3UPP8 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cep63Q3UPP8 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cep63Q3UPP8 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Cep63Q3UPP8 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cep63Q3UPP8 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cep63Q3UPP8 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Cep63Q3UPP8 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cep63Q3UPP8 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cep63Q3UPP8 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cep63Q3UPP8 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cep63Q3UPP8 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cep63Q3UPP8 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cep63Q3UPP8 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cep63Q3UPP8 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cep63Q3UPP8 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cep63Q3UPP8 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cep63Q3UPP8 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cep63Q3UPP8 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cep63Q3UPP8 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Cep63Q3UPP8 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cep63Q3UPP8 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cep63Q3UPP8 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cep63Q3UPP8 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cep63Q3UPP8 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cep63Q3UPP8 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cep63Q3UPP8 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Cep63Q3UPP8 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cep63Q3UPP8 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Cep63Q3UPP8 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cep63Q3UPP8 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cep63Q3UPP8 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cep63Q3UPP8 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Cep63Q3UPP8 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cep63Q3UPP8 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Cep63Q3UPP8 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cep63Q3UPP8 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cep63Q3UPP8 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cep63Q3UPP8 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cep63Q3UPP8 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cep63Q3UPP8 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cep63Q3UPP8 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cep63Q3UPP8 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cep63Q3UPP8 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cep63Q3UPP8 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cep63Q3UPP8 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Cep63Q3UPP8 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Cep63Q3UPP8 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Cep63Q3UPP8 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Cep63Q3UPP8 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Cep63Q3UPP8 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cep63Q3UPP8 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cep63Q3UPP8 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cep63Q3UPP8 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Cep63Q3UPP8 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Cep63Q3UPP8 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cep63Q3UPP8 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cep63Q3UPP8 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cep63Q3UPP8 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Cep63Q3UPP8 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cep63Q3UPP8 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cep63Q3UPP8 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cep63Q3UPP8 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cep63Q3UPP8 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cep63Q3UPP8 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cep63Q3UPP8 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cep63Q3UPP8 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cep63Q3UPP8 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cep63Q3UPP8 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cep63Q3UPP8 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cep63Q3UPP8 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cep63Q3UPP8 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cep63Q3UPP8 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Cep63Q3UPP8 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cep63Q3UPP8 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cep63Q3UPP8 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cep63Q3UPP8 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cep63Q3UPP8 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cep63Q3UPP8 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cep63Q3UPP8 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cep63Q3UPP8 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cep63Q3UPP8 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cep63Q3UPP8 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cep63Q3UPP8 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cep63Q3UPP8 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Cep63Q3UPP8 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cep63Q3UPP8 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cep63Q3UPP8 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cep63Q3UPP8 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms