Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPH1

Prrc1, Protein PRRC1, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc1Q3UPH1 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Prrc1Q3UPH1 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prrc1Q3UPH1 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prrc1Q3UPH1 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prrc1Q3UPH1 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prrc1Q3UPH1 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prrc1Q3UPH1 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prrc1Q3UPH1 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prrc1Q3UPH1 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prrc1Q3UPH1 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prrc1Q3UPH1 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prrc1Q3UPH1 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prrc1Q3UPH1 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prrc1Q3UPH1 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prrc1Q3UPH1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prrc1Q3UPH1 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prrc1Q3UPH1 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Prrc1Q3UPH1 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prrc1Q3UPH1 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prrc1Q3UPH1 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prrc1Q3UPH1 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prrc1Q3UPH1 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prrc1Q3UPH1 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prrc1Q3UPH1 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prrc1Q3UPH1 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prrc1Q3UPH1 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prrc1Q3UPH1 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prrc1Q3UPH1 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prrc1Q3UPH1 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prrc1Q3UPH1 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prrc1Q3UPH1 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Prrc1Q3UPH1 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prrc1Q3UPH1 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prrc1Q3UPH1 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prrc1Q3UPH1 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prrc1Q3UPH1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prrc1Q3UPH1 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prrc1Q3UPH1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prrc1Q3UPH1 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prrc1Q3UPH1 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prrc1Q3UPH1 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prrc1Q3UPH1 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prrc1Q3UPH1 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prrc1Q3UPH1 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prrc1Q3UPH1 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prrc1Q3UPH1 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prrc1Q3UPH1 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prrc1Q3UPH1 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prrc1Q3UPH1 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prrc1Q3UPH1 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prrc1Q3UPH1 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Prrc1Q3UPH1 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prrc1Q3UPH1 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prrc1Q3UPH1 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prrc1Q3UPH1 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prrc1Q3UPH1 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prrc1Q3UPH1 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prrc1Q3UPH1 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prrc1Q3UPH1 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prrc1Q3UPH1 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prrc1Q3UPH1 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prrc1Q3UPH1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prrc1Q3UPH1 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prrc1Q3UPH1 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prrc1Q3UPH1 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prrc1Q3UPH1 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prrc1Q3UPH1 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prrc1Q3UPH1 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prrc1Q3UPH1 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prrc1Q3UPH1 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prrc1Q3UPH1 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prrc1Q3UPH1 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prrc1Q3UPH1 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prrc1Q3UPH1 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prrc1Q3UPH1 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prrc1Q3UPH1 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prrc1Q3UPH1 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prrc1Q3UPH1 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Prrc1Q3UPH1 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prrc1Q3UPH1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prrc1Q3UPH1 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prrc1Q3UPH1 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Prrc1Q3UPH1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prrc1Q3UPH1 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prrc1Q3UPH1 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prrc1Q3UPH1 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prrc1Q3UPH1 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Prrc1Q3UPH1 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Prrc1Q3UPH1 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Prrc1Q3UPH1 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Prrc1Q3UPH1 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Prrc1Q3UPH1 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prrc1Q3UPH1 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prrc1Q3UPH1 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prrc1Q3UPH1 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prrc1Q3UPH1 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Prrc1Q3UPH1 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prrc1Q3UPH1 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prrc1Q3UPH1 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prrc1Q3UPH1 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms