Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW8

Parp3, Poly [ADP-ribose] polymerase, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp3Q3ULW8 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Parp3Q3ULW8 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Parp3Q3ULW8 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Parp3Q3ULW8 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Parp3Q3ULW8 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Parp3Q3ULW8 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Parp3Q3ULW8 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Parp3Q3ULW8 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Parp3Q3ULW8 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Parp3Q3ULW8 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Parp3Q3ULW8 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Parp3Q3ULW8 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Parp3Q3ULW8 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Parp3Q3ULW8 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Parp3Q3ULW8 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Parp3Q3ULW8 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Parp3Q3ULW8 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Parp3Q3ULW8 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Parp3Q3ULW8 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Parp3Q3ULW8 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Parp3Q3ULW8 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Parp3Q3ULW8 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Parp3Q3ULW8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Parp3Q3ULW8 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Parp3Q3ULW8 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Parp3Q3ULW8 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Parp3Q3ULW8 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Parp3Q3ULW8 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Parp3Q3ULW8 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Parp3Q3ULW8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Parp3Q3ULW8 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Parp3Q3ULW8 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Parp3Q3ULW8 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Parp3Q3ULW8 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Parp3Q3ULW8 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Parp3Q3ULW8 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Parp3Q3ULW8 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Parp3Q3ULW8 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Parp3Q3ULW8 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Parp3Q3ULW8 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Parp3Q3ULW8 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Parp3Q3ULW8 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Parp3Q3ULW8 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Parp3Q3ULW8 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Parp3Q3ULW8 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Parp3Q3ULW8 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Parp3Q3ULW8 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Parp3Q3ULW8 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Parp3Q3ULW8 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Parp3Q3ULW8 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Parp3Q3ULW8 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Parp3Q3ULW8 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Parp3Q3ULW8 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Parp3Q3ULW8 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Parp3Q3ULW8 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Parp3Q3ULW8 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Parp3Q3ULW8 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Parp3Q3ULW8 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Parp3Q3ULW8 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Parp3Q3ULW8 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Parp3Q3ULW8 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Parp3Q3ULW8 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Parp3Q3ULW8 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Parp3Q3ULW8 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Parp3Q3ULW8 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Parp3Q3ULW8 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Parp3Q3ULW8 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Parp3Q3ULW8 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Parp3Q3ULW8 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Parp3Q3ULW8 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Parp3Q3ULW8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Parp3Q3ULW8 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Parp3Q3ULW8 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Parp3Q3ULW8 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Parp3Q3ULW8 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Parp3Q3ULW8 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Parp3Q3ULW8 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Parp3Q3ULW8 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Parp3Q3ULW8 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Parp3Q3ULW8 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Parp3Q3ULW8 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Parp3Q3ULW8 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Parp3Q3ULW8 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Parp3Q3ULW8 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Parp3Q3ULW8 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Parp3Q3ULW8 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Parp3Q3ULW8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Parp3Q3ULW8 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Parp3Q3ULW8 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Parp3Q3ULW8 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Parp3Q3ULW8 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Parp3Q3ULW8 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Parp3Q3ULW8 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Parp3Q3ULW8 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Parp3Q3ULW8 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Parp3Q3ULW8 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Parp3Q3ULW8 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Parp3Q3ULW8 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Parp3Q3ULW8 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Parp3Q3ULW8 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms